بررسی ساختار پروتئینی نوروترنسمیتر گابا ((GABA(A و (GABA(B) با استفاده از مدلهای آماری بیوانفورماتیکی

گاما آمینو بوتیریک اسید (GABA) یکی از مهمترین گیرنده های مهاری در ساختارهای قشری- غشایی، هیپوکامپال، تالاموس، بازال گانگلیای مغز انسان می باشد که نقش عمده ای در فعالیتهای فیزیولوژیک بدن انسان مانند حافظه، ترس، درد، خواب، اضطراب و گرسنگی دارد، همچنین از مهمترین گیرنده های تأثیرگذار در درمان صرع و آلزایمر می باشد. براساس ساختار مولکولی و فعالیت، گیرنده گاما به دو دسته اصلی گابا (A) و (B) تقسیم می شوند که شناسایی آنها از لحاظ دارو شناختی و الکتروفیزیولوژیکی دارای اهمیت ا ست. ابا (A) دارای چندین زیرواحد و هر کدام از زیرواحدها دارای آیزوفرمهای مختلفی می باشد. روش: با استفاده از سایت Expassy، پایگاه داده های پروتئینی (Prot-Uni)، توالی های پروتئینی نوروترنسمیتر گابا به تعداد 221 پروتئین در دو دسته اصلی پروتئینهای گابا (A) و گابا (B) پرداخته و با آنالیز آنها متغیرهای تعیین کننده دو نوع اصلی گابا (A) و (B) تعیین گردید. نتیجه گیری: مهمترین ویژگی بدست آمده از 80% مدلهای Attribute Weighting مربوط به فراوانی CysAsp می باشد. الگوریتم Tree induction بیشترین دقت و صحت را با 96.40% مربوط به Decision tree parallel Gini index می باشد.

Keywords:

نوروترنسمیتر گابا (A و B) , مدل tree induction , Attribute Weighting