CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی فیلوژنتیکی ژرم پلاسم های سیب با استفاده از ISSR و نرم افزار PyElph

عنوان مقاله: بررسی فیلوژنتیکی ژرم پلاسم های سیب با استفاده از ISSR و نرم افزار PyElph
شناسه ملی مقاله: CIGS12_0925
منتشر شده در دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

شکوفه فاضلی - دانشجوی کارنشاسی ارشد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
مسعود شیدایی - استاد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
رضا ذاتی کیخا - دانشجوی کارنشاسی ارشد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
سیما دامیار - موسسه تحقیقات نهال و بذرکرج

خلاصه مقاله:
سیب (malus domestica Borkh) از نظر اقتصادی یکی از مهمترین درختان میوه در جهان است. حدود 59 گونه و 7500 رقم در سراسر دنیا شناسایی شده است. در این پژوهش، با استفاده از مارکر مولکولی ISSR، انگشت نگاری و تعیین درجه شباهت بین 6 رقم سیب بومی و تجاری، شامل رقم های شفیع آبادی، گلاب کهنز red starking, delbarstival, idared و royal gala با استفاده از 3 پرایمر UBC810, (AGC)5GG و(GA(9C توسط نرم افزار PyElph صورت گرفت. پس از انجام PCR و تهیه ژل آگارز، الکتروفورز افقی انجام شد و بعد از رنگ آمیزی با اتیدیوم بروماید، با استفاده از اشعه UV تصویر ژل به دست آمد و در نرم افزار PyElph مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. PyElph یک نرم افزار open source بر پایه Python (یک زبان برنامه نویسی) برای تحلیل و بررسی تصاویر ژل بوده که می تواند برای مطالعات مختلف ژنتیکی و زیست شناسی مورد استفاده قرار گیرد. درخت UPGMA حاصل از نرم افزار PyElph نشان دهنده شباهت ژنتیکی رقم های delbarstival, royal gala و red starking است، این درخت نزدیکی دو رقم گلاب کهنز و idared را نیز نشان می دهد. در احلیکه رقم شفیع آبادی با فاصله بیشتری نسبت به سایر ژنوتیپ ها قرار گرفته که نشان دهنده تفاوت بیشتر این رقم با سایر ارقام است.

کلمات کلیدی:
سیب، ISSR، نرم افزار PyElph

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/227192/