چند شکلی حاصل از عناصر رتروترنسپوزونی Tvv1 و Huben در ارقام انگور
Publish place: 2nd National Conference on Climate Change and its Impact on Agriculture and the Environment
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 466
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NCCCIAE02_459
تاریخ نمایه سازی: 22 اردیبهشت 1393
Abstract:
رتروترنسپوزونها فراوانترین و گسترده ترین عناصر جابه جا شونده در ژنوم یوکاریوتها می باشند. چندشکلی ادغامی و فراوانی آنها درژنومهای گیاهی استفاده از آنها را به عنوان نشانگرهای ملکولی ایدهال میسازد.به منظور مطالعه فعالیت و چندشکلی ادغامی عناصررتروترنسپوزونی Tvv1 و Huben در 67 رقم مختلف انگور (.VitisviniferaL)، از نشانگرهای (amplified polymorphism Inter retrotransposon (IRAP و Retrotransposon microsatellite amplified polymorphism (REMAP) استفاده شد.از 15 آغازگرمورد استفاده، یک آغازگر IRAP و سه آغاز گر REMAP الگوی باندی واضح و چند شکل تولید نمودند. چهار آغازگر در مجموع 26 مکان تکثیر نمودند که از این تعداد 22 مکان (84/6 درصد) چند شکل بودند. در ترکیب آغازگری حاصل از دو خانواده رتروترنسپوزونی (Tvv1-Huben) باندی تولید نشد که بیانگر عدم ادغام این دو خانواده رتروترنسپوزونی در مجاور هم در ژنوم انگور میباشد. فراوانی تمام مکان های تکثیری بیش از 5 درصد بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار برای آغازگرها از 0/28 (آغاز گر Huben-A7) تا 0/38 (آغازگر Tvv1-849) متغیر بود. دندروگرام حاصل از تجزیه کلاستر به روش UPGMA مبتنی بر ضرایب تشابه دایس، ارقام مورد مطالعه را درهفت گروه اصلی متمایز نمود. افراد با فاصله ژنتیکی مناسب می توانند به عنوان والدین بالقوه در برنامه های اصلاحی و به نژادی انگور مورد استفاده قرار گیرند.
Keywords:
Authors
معصومه فرخ نیا
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه
بابک عبدالهی مندولکانی
استادیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه
حامد دولتی بانه
استادیار پژوهش مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان غربی
ایرج برنوسی
دانشیار گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه