آنالیز فیلوژنی مولکولی اعضای قبیله Eritrichieae از خانواده گاوزبان بر اساس توالی کلروپلاستی psbA- trnH

قبیله Eritrichieae متعلق به خانواده گاوزبان بوده و دارای 62 گونه در ایران می باشد. در تحقیق حاضر از توالی نوکلئوتیدیtrnH- psbA جهت تعیین موقعیت تاکسونومیکی این قبیله استفاده گردید. از مزایای توالی مذکوراین است که از نمونه هایهرباریومی با محتوای ژنومی خرد شده به راحتی قابل تکثیر است و به دلیل نرخ بالای جانشینی به عنوان اولین توالی برایDNA نشانگرمطرح شده است. در این پژوهش ابتدا DNA کل از برگ نمونه های گیاهی استخراج شده و سپس قطعه ی ژنیpsbA- trnH با استفاده از دستگاه ترموسیکلر تکثیر شد. پس از چک کردن کمیت و کیفیت قطعه با الکتروفورز، محصولاتPCR جهت توالی یابی فرستاده خواهند شد. سپس هم ردیف سازی توالی های انجام شده با برنامه MUSCLE یا Clustal X انجام گرفته و به دنبال آن جهت نشان دادن قرابت گونه ها ،آنالیز فیلوژنی با نرم افزار های نظیر RAxML ،MrBayes ، PAUP انجام گرفت. نتایج نشان داد قبیله مذکور تک تبار نمی باشد. گونهAsperugo procumbens در قاعده درخت قرار می گیرد، دو جنس Heterocaryum و Rochelia تک تبارند ولی جنس های Lappula و Lepechiniella تک تبار نیستند. گونه های جنس Lepechiniella توالی های نوکلئوتیدی مشابه با Lappula microcarpa وL. barbata نشان دادند

Keywords:

RAxML , MrBayes , Paup , Eritrichieae قبیله