ساخت یک محیط محاسبات شبکه ای برای بیوانفورماتیک

Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 592

نسخه کامل این Paper ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

IBIS04_042

تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393

Abstract:

محاسبات اینترنتی و فناوری های شبکه ای برای تغییر راه مقابله با مسائل پیچیده وعده می دهند. آنها اجتماع مقیاس بزرگی و اشتراک گذاری محاسباتی،داده ها و سایر منابع در سرتاسر مرزهای سازمانی را فعال خواهند کرد. و بهره برداری از این فناوری های جدید بطور موثر رشته های علمی اعم از فیزیک رابه علوم زندگی تبدیل خواهد کرد. تجزیه و تحلیل از توالی زیستی، نوعی از علوم محوری محاسباتی است. بخاطر اینکه دادههای زیست شناسی به سرعت درحال رشد هستند، این پایگاه داده های ناهمگن هستند. ما می توانیم از سیستم های شبکه ای برای اشتراک گذاری و یکپارچه سازی پایگاه دادههای بیولوژی ناهمگن استفاده کنیم. همان طور که می دانید، ابزارهای بیوانفورماتیک می تواند به تجزیه و تحلیل اطلاعات توالی در اندازه های بزرگ، بخوصوص در موردترتیب توالی، سرعت بخشد. FASTA ابزاری برای تنظیم پروتئین های مختلف و یا توالی نوکلئوتید است. FASTA یک نسخه توزیع شده و موازی است که ما استفاده می کنیم. این نرم افزار با استفاده از یک کتابخانه عبور پیام بنام MPI (رابط عبور پیام) و روی خوشه های ایستگاه کاری توزیع شده و به همان اندازه کامپیوتر های موازی سنتی اجرا می شود.

Authors

فرزین خسروی دانش

کارشناسی ارشد علوم کامپیوتر ، کارشناسی علوم آزمایشگاهی

نغمه عسگری

کارشناسی مهندسی نرم افزار