تشخیص ساختار طبیعی پروتئین با استفاده از تابع نمره دهی مبتنی بر مفروش سازی دلونی

پیشگویی ساختار پروتئین یکی از مسائل مهم در بیوانفورماتیک است. عموماً فرض می شود که ساختار پروتئین در مینیمم انرژی قرار دار د. لذا تابع انرژی مناسب برای تشخیص و پیشگویی ساختار حائز اهمیت است. توابع پتانسیل آماری که مبتنی بر اطلاعات موجود در ساختار پروتئین های شناخته شده هستند، با افزایش ساختارهای کریستال شده بیشتر مورد توجه قرار گرفته اند. سه عامل مهم در توابع پتانسیل آماری وجود دارند که عبارتند از نوع نمایش ساختار(اسید آمینه ای یا اتمی)، متغیر ساختاری( فاصله جفت اتمها، سطح در دسترس و ....) و وضعیت مرجع. توابع پتانسیل آماری متعددی وابسته به این سه عامل وجود دارند. در این مقاله، سعی می شود با اشاره به توابع پتانسیل موجود و نحوه ساختن آنها، تابع پتانسیل ساده تر و دقیقتری که مبتنی برمفروش سازی دلونی است ارایه گردیده و نقاط قوت و دلایل برتری آن نسبت به روشهای موجود مورد بحث قرار گیرد

Keywords:

ساختار پروتئین , تابع پتانسیل آماری , مفروش سازی دلونی