تجزیه و تحلیل داده های میکرواری مربوط به تاثیر دود سیگار بر سلول های مخاط دهان در مردان و زنان

از جمله مشکلاتی که جوامع امروزی با آن روبرو هستند، مساله اعتیاد و استفاده از دخانیات است. اولین ناحیه ای که در معرض مواد مضر موجود در دودسیگار می باشد مخاط دهان و حلق است مخاط دهان انسان تحمل تماس طولانی مدت با دود سیگار را ندارد. در این مطالعه تاثیر دود سیگار بر رونوشت های مخاط دهان مردان و زنان مورد بررسی قرار گرفت، بدین منظور داد ه های خام از پایگاه اطلاعاتیGEO دریافت شد و بوسیله نرم افزارExpression console نرمال سازی داده ها انجام شد و داده های نرمال شده جهت آنالیز با کمک نرم افزار FlexArray1.6.1 مورد استفاده قرار گرفت. جهت تعیین تفاوت معنی دار بیان ژنها از روش 2-sample Bayesian t-test استفاده شد. نتایج نشان داد زنان سیگاری نسبت به زنان غیر سیگاری برای 12 ژن افزایش بیانو برای 5 ژن کاهش بیان نشان دادند و مردان سیگاری نسبت به مردان غیر سیگاری برای 9 ژن افزایش و برای2 ژن کاهش بیان نشان دادند. علاوه بر این7ژن افزایش بیان یافته در مردان و زنان سیگاری مشترک بودند که بیان آنها در زنان بیشتر از مردان بود که این ژنها شاملLOR ،RPTN ،CYP1B1 ، S100A7 وCEACAM7 بودند که از بین ژن CYP1B1 جهت آنالیز بیشتر مورد ارزیابی قرار گرفت رسم شبکه پروتئینی برایاین ژن نشان داد که این ژن در متابولیسم استروئید درگیر است.

Keywords:

2-sample Bayesian t-test , FlexArray