CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

کاوش قوانین وابستگی در توالی های ویروس آنفولانزا

عنوان مقاله: کاوش قوانین وابستگی در توالی های ویروس آنفولانزا
شناسه ملی مقاله: IBIS04_109
منتشر شده در چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

مریم بهرامی دراسله - دانشگاه شیراز دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر
اشکان سامی - دانشگاه شیراز دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر
اسماعیل ابراهیمی - دانشگاه شیراز دانشکده کشاورزی بخش زراعت و اصلاح نباتات
محمدهادی صدرالدینی - دانشگاه شیراز دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر

خلاصه مقاله:
ویروس آنفولانزا از سال 1900 تاکنون، منجر به چهار اپیدمی مرگبار در سراسر جهان شده است: 1918-آنفولانزای اسپانیایی-H1N1، 1957-آنفولانزایآسیایی- H2N2، 1968-آنفولانزای هنگ کنگ- H3N2 و 2009- H1N1.علاوه بر شیوع سریع، نرخ بالای جهش اعم از تغییر آنتیژن و انحراف آنتیژن ،کارایی واکسن را کاهش دادهاست، از اینرو واکسن آنفولانزا نیاز به بازنگری سالانه دارد و بهاین دلیل استخراج سالانه الگوی ویروس در گردش، ضروری اس ت. مشکل دیگر این است که دیتاستهای آنفولانزا در تمام زیرگروههای آن، توزیع نامتوازنی دارد. از CBA، طبقهبندی بر اساس قوانین وابستگی، که یکی ازتکنیکهای دادهکاوی برای کشف قوانینی است که منجر به کلاس مشخصی میشوند، برای استخراج الگوی ویروس استفاده شد. برای حل مشکل عدم توازندادههای ویروس از زیرگروههای مختلف، آستانههای متفاوتی از support و confidence بر مبنای فرکانس هر زیرگروه در دیتاست استفاده شد. نهایتاتوانستیم قوانین با اطمینان بالا، تقریبا 100% ، برای هر کدام از زیرگروههای ویروس استخراج کنیم، برای نمونه در توالی DNA آنتیژن هماگلوتینین قانونC410=G ->H=1, Support=40%, Confidence=100% و قانون C1617=A ->H=3, Support=26%, Confidence=100% بدست آمد. قوانین بدست آمده، در سیستمهای مبتنی بر قانون، نیز با توجه به طول زیاد توالیها، در استخراج نواحی موثر در توالی بهمنظور کاهش حجم بالای داده، برای

کلمات کلیدی:
آنفولانزا، کاوش قوانین وابستگی، توالی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/287663/