مطالعه بیوانفورماتیکی پلیگالاکتورونازهای قارچی

پکتینازها آنزیم هایی هستند که توسط عوامل بیماریزای قارچی جهت نفوذ به سلول گیاهی ترشح م یشوند، از میان پکتینازها، پل یگالاکتورونازها(PG) ، نقش مهمی در تجزیه دیواره سلول گیاهی دارند. پل یگالاکتورونازها پیوند 4(→1) زنجیره پلیگالاکتورونیک اسید را با اکسیداسیون و آزاد کردن آبهیدرولیز مینمایند. این آنزیمها بر اساس خصوصیات عمل آنزیمی در تجزیه سوبسترا، به دو نوع اندوپلیگالاکتوروناز (بطور تصادفی پلیمر را شکسته) و اگزوپلیگالاکتوروناز(تجزیه کننده انتهایی) طبقهبندی میشون د. اندوپل یگالاکتورونازها و اگزوپلیگالاکتورونازه ا به عنوان عضوی از خانواده گلیکوزید-هیدرولاز(GH28) طبقهبندی شدهاند. پلیگالاکتورونازها از منابع مختلف قارچی جهت تعیین موتیفهای حفاظت شده و عملکردی توسطClustalW موردبررسی قرار گرفتند، در تمام 131 پلیگالاکتورونازی که بررسی گردید، چهار موتیف بسیار حفاظت شده (NTD, G/QDD, G/SHG, RIK) تعریفگردیدند. همچنین خصوصیات بیوشیمیایی، ساختار مولکولی و روند تکامل ژنتیکی آنها مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت. مطالعه وزن مولکولی و نقطهایزوالکتریک حاکی از تنوع فاحشی بین انواع پلیگالاکتورونازها در منابع قارچی مختلف بود. همچنین بررسیهای فیلوژنتیکی نشان داد، پل یگالاکتورونازهایمختلف قارچی متعلق به زیرگروههای مختلف میباشند و بر همین اساس تلاش گردید با استفاده از خصوصیات بیوشیمیایی و ساختاری پل یگالاکتورونازها ونیز فاکتورهایی مانند وجود یا فقدان سیگنال پپتید و غشایی یا سطحی بودن این آنزیمها، طبقهبندی تکاملی قارچهای تولیدکننده پلیگالاکتورونازه ا را توسط تنوع موجود در پلیگالاکتورونازها بررسی کنیم.

Keywords:

پلیگالاکتوروناز , منابع قارچی , خصوصیات بیوشیمیایی , طبقهبندی تکاملی