شناسایی عوامل کنترل کننده بیماری آتشک گلابی در شرایط آزمایشگاه توسط روشهای مولکولی

جدایه هایی از باکتری Pantoea در نتیجه کشت متقابل با باکتری Erwinia amylovora در برابر این باکتری هاله بازدارندگی نشان داده است و از رشدآن ممانعت به عمل آورد.این جدایه ها با استفاده از آغازگر ژن پلی مراز ریبوزومی زیر واحد بتا ( ( rpoBتکثیر گردید. تعیین توالی محصولاتPCR در هردو جهت سنس و آنتی سنس و با استفاده از آغازگرهای مذکور انجام شد توالی های بدست آمده ابتدا با استفاده از نرم افزار Seqman اصلاح شده و سپس بابه کارگیری برنامه BLAST (NCBI)، با توالی های دیگر موجود در بانک ژن همردیف گردیدند. توالی های مورد نظر با توالی های موجود در بانک NCBI بااستفاده از الگوریتم ClustalW الاین شد و سپس به روش نیبرجوینینگ با استفاده از نرم افزار مگا 5 فیلوژنی جدایه ها با توالی چندین گونه ازPantoea ترسیم گردید و بیانگر آن است که جدایه ها شباهت بالایی با جدایه های Pantoea ananatis و در سطح پایین تری با جدایه هایPantoea alii داش ت.و قرابت نسبتا دورتری با Pantoea agglomerans داشتند. نتایج مشاهدات نشان می دهد باکتری های اپی فیت pantoea که از گیاهان مختلف جمع آوریشده در شرایط آزمایشگاه باکتری عامل آتشک سیب و گلابی را کنترل می کند.

Keywords:

Pantoea , rpoB , MEGA5