غفار حضری - بخش بیوانفورماتیک پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
زهرا سادات شبر - بخش بیوانفورماتیک پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
امیرمحمد ناجی - دانشکده کشاورزی دانشگاه شاهد
رضا فتوت - دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان

تنش های زیستی و غیرزیستی از مهمترین عوامل محدودکننده عملکرد گیاهان زراعی می باشند. خانواده ی ژنیWRKY رمزکننده گروه بزرگی از عواملرونویسی هستند که در تنظیم ژنهای پاسخ دهنده به تنش های زیستی و غیر زیستی دخیل هستند. بنابراین شناسایی و مطالعهی این خانوادهی ژنی بهمنظور دستورزی و تنظیم بیان آنها راهکار ارزنده ای برای تحمل گیاهان به تنش ها خواهد بود. برای شناسایی اعضای این خانواده در گندم، جستجویچندگانه در پایگاه های اطلاعاتی مرتبط و tblastn بر اساس توالی های حفظ شده ی این خانواده در برنج در داده های HTGS ،EST ،nr انجام شد. توال یهایی مثل EST و cDNA (فاقد پروتئین) توسط نرم افزارهایDNAstar و NCBI ORF finder ترجمه شدند. توالی ها توسط نرم افزارMEGA4 همردیف شدند و درخت فیلوژنتیکی بر مبنای Boot strap neighbor-joining رسم شد. نمای گرافیکی و شباهت زیر گروه ها با نرم افزارBio Edit مشخص شد. در این بررسی 59 عضو از این خانواده در گندم یافت شد. 67 عضو پیدا شده ساختار حفظ شده خانوادهWRKY را به طور کامل داشتن د (توالیهای پروتئینی ناقص عمدتاً از ترجمه ی ESTها یا mRNA های ناقص به دست آمده بودند) که شامل 61 عضو از گروهI ، 83 عضو از گروهII و 22 عضو از گروه III بودند. نواحی حفاظت شده ی هر گروه در گندم مشخص شد .بر اساس روابط فیلوژنتیکی در گروه II به ترتیب6، 31، 11، 6 و 2 عضو درزیر گروه های IId ،IIc ،IIb ،IIa و IIe قرار گرفتند. زیر گروه های IIIa و IIIb در گروه III نیز به ترتیب دارای 01 و 21 عضو بودند.

گندم، تنش های زیستی و غیر زیستی، خانواده ی ژنی WRKY، عوامل رونویسی