شناسایی بیوانفورماتیکی micro RNA ها و ژنهای هدف آنها در هلو

Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 620

نسخه کامل این Paper ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

IBIS04_152

تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393

Abstract:

) ها کلاسی از RNA های کوچک هستند که اخیرا کشف شده اند .miRNA های گیاهی اولین با ر در آرابیدوپسی س در سا ل2002 گزارش شدند. این RNA ها توالیهای درونی غیر کد شونده از RNAهای کوچک میباشند و نقش مهمی در تنظیم بیان ژن پس از رونویسی ایفا م یکنن د. آ نها به عنوان تنظیم کنندههای منفی بیان ژن در یوکاریوت ها فعالیت میکنند. ژن های miRNA توسط آنزیم (RNA PolymeraseII (Pol-II رونویسیمی شوند. پس از رونویسی به انتهای ˊ5 pri-miRNA (primary miRNA) کلاهک cap اضافه شده وانتهای `3 پلی آدنیله می شو د .نهایتا بر اساسجفت شدن بازها ساختمانstem-loop شکل می گیرد. pri-miRNAها به وسیله کمپلکیسmicroprocessor که شامل نوکلئازه ایDicer- like1(DCL) و HYL1 است پردازش می شوند. آ نها توسط آنزیم HEN متیله شده و از طریق پروتئین HASTY که یک انتقال دهنده miRNA است بهسیتوپلاسم انتقال می یاب د. در این مرحلهmiRNA ی بالغ تولید شده در برابر کمپلکسRISC(RNA-induced ribonocleoproteinsilencing complex) بارگذاری می شود. RNAی تک رشته ای درکمپلکس RISC قرار می گیرد. این RNA دارای توالی تکمیلی با mRNAی هدف خود است و بهمحض جفت شدن با آن فعالیت تنظیمی انجام می دهد. miRNAها از طریق قطعه قطعه کردن mRNAی هدف خود و یا جلوگیری از ترجمه، فعالیتتنظیمی خود را اعمال می کنند miRNA ها در گیاه نقش های مهمی از جمله : رشد، هدایت سیگنال ، تجزیه پروتئین، پاسخ به تنشهای محیطی و هجومعوامل بیماری زا و همچنین تنظیم بیوژنز خود را ایفا میکنند. آ نها از طریق قطعه قطعه کردن mRNAی هدف و یا جلوگیری از ترجمه ، فعالیت تنظیمیبر روی ژن های هدف خود اعمال میکنند. در این مطالعه به منظور شناسایی miRNAها و پی شبینی ژ نهای هدف آ نها در هل و از روش آنالیزEST ،ppe-mir159e ،ppe-mir156i ،ppe-mir156d ،ppe-mir156b ،ppe-mir156a : متعلق به 71 خانواده شامل miRNA استفاده شد که تعداد 62 عددppe- ،ppe-mir408e،ppe-mir408 ،ppe-mir182c ،ppe-mir5048 ،ppe-mir171g ،ppemir171f ،ppe-mir171d ،ppe-mir171b ،ppe-mir171a ppe- ،ppe-mir160 ،ppe-mir5071 ،ppe-mir2093-5p ،ppe-mir1873،ppe-mir1426 ،ppe-mir812f ،ppe-mir440 ،ppe-mir419 ،mir414 .به همراه ژن های هدف آن ها شناسائی شد ppe-mi2275b ،mir399d

Keywords:

Authors

فضیله اسماعیلی

دانشجوی کارشناسی ارشد رشته بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه شهرکرد

بهروز شیران

دانشیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه شهرکرد