سازی و بررسی ساختار پروتئین مرتبط با پاتوژن (PRپروتئین ها) در گیاه Hordeum vulgare L.
Publish place: 4th Iranian Conference on Bioinformatics
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 915
نسخه کامل این Paper ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBIS04_158
تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393
Abstract:
پروتئین های مرتبط با پاتوژن (PRپروتئین ها) گروهی از مهمترین پروتئین هایی هستند که در گیاه در مواجه با پاتوژن ها القاء می شوند. در این تحقیق ساختار های اولیه و ثانویه این انتی پورتر مورد ارزیابی قرار گرفت و مشخص گردید که قسمت اعظم این آنتی پورتر بصورت هیدروفیل می باشد و ساختار ثانویه الفا هلیکس ساختار غالب در این پروتئین می باشد همچنین ساختار سه بعدی این پروتئین نیز با استفاده از نرم افزار مدلر ساخته شد و به منظور پالایش ساختار سه بعدی، تحت کاهش انرژی قرار گرفت. مدل ساخته شده همچنین به منظور ارزیابی کیفیت مدل با استفاده از نمودار راماچاندران و الگوریتم QMEAN مورد ارزیابی قرار گرفت نتایج حاکی از کیفیت بالای مدل ساخته شده بود.
Keywords:
Authors
بهمن پناهی
گروه بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه تبریز
وحید اصلان زاده
گروه بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه زنجان
عسگر پناهی
گروه زیست شناسی دانشگاه محقق اردبیلی