بررسی بیوانفورماتیکی ژن سکوالن سینتاز در گونههای مختلف گیاهی

شیرینبیان یکی از مهمترین گیاهان دارویی میباشد که حاوی تریترپن فعال ساپونین (گلیسریزین) است. از میان ژن های موجود در این گیاه ژن سکوال ن سینتاز (Squalene Synthase) نقش تنظیم کنندگی مهمی در بیوسنتز تریترپن ساپونین ایفا می کند. بیان بالای ژن سکوالن سینتاز(SQS) روی تجمعگلیسریزین و ساپونین های تریترپن تأثیر می گذار د. در این مطالعه توالی های گزارش شده ژنSQS در گون ههای مختلف گیاهی مورد آنالیزهایبیوانفورماتیکی قرار گرفت، که به این منظور از پایگاههای اطلاعاتی NCBI و نرم افزارهای CLC Main workbench5 و DNA stare استفاده شده است. بااستفاده از این نرم افزارها، آنالیزهایی از قبیل تعیین شباهت بین توالیهای مختلف و ترسیم درخت فیلوژنتیکی انجام گرفت. از مجموع تعداد87 ژن گزارششده در دیتا بیس برای ژن SQS، 14 ژن مربوط به گونه های مختلف شیرین بیان می باشد و 73 ژن در سایر جن سها از قبیل سویا و غیره م یباش د. نتیجههمردیفی (Alignment) نشان داد که بیشترین شباهتها مربوط به توالیهای SQS در شیرین بیان می باشد و کمترین تشابه مربوط به Glycyrrhiza glabra با Psammosilene tunicoides م یباشد. مطالعه درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده نشانگر قرار گرفتن توالیهای مربوط به Glycyrrhiza glabraPsammosilene tunicoides در یک گروه (با حداکثر شباه ت) میباشد که این گروه با Glycyrrhiza uralensis (GQ266154.1)و (D86409.1) .بیشترین فاصله را دارد (EF585250.1)

Keywords:

شیرینبیان , سکوالن سینتاز , همردیفی , درخت فیلوژنی