مهران فلک ناز - گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
شیدا فرخیان - گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه شهید باهنر کرمان
محمد سعید همتی - گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه کردستان
حسن رسولی - گروه پژوهشی بیوتکنولوژی مقاومت به خشکی دانشگاه رازی کرمانشاه؛ عضو هیت مدیره شرکت فنی مهندسی کشاورزی سبزآذین راگا- تهران

در این تحقیق از 51 توالی از ژن های کد کننده پروتئین LEA در خانواده پیناسه که از سایت پایگاه اطلاعات ژنتیکی NCBI استخراج شده بود استفاده شد. سپس آنزیمهای برشی که دارای بیشترین سایت برشی در این 3 خانواده بودند توسط نرم افزار آنلاین Webcuter انتخاب شدند، که این آنزیم ها به ترتیب عبارتند از: AluBI با سایت برشی AGCT و برش به صورت انتهای صاف، FatI با سایت برشی CATG به صورت انتهای صاف و Bim19II با سایت برشی GGCC و برش به صورت انتهای صاف، سپس توسط نرم افزار CLC main Workbench به توالیها اعمال و نتایج توسط همین نرم افزار به صورت شبیه ساز بروی ژل برده شد. در مرحله بعد با توجه به وجود و یا عدم وجود باند به نمونه ها امتیاز 0 و 1 داده و در نرم افزار Excel ذخیره شدند، سپس توسط نرم افزار Darwin ماتریس های عدم تشابه بر اساس الگوریتم های دایس و جاکارد بدست آمده و توسط نرم افزار Mega درخت فیلوژنتیکی رسم و تفسیر شد. براساس نتایج حاصل از این بررسی خانواده پیناسه به لحاظ دارا بودن ژن کدکننده پروتئین LEA در 7 دسته طبقه بندی می شوند.

ا Insilco AFLP Analysis ، خانواده پیناسه، تنوع فیلوژنتیکی، LEA