CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

شناسایی باکتری عامل لکه زاویه ای توسکای ییلاقی از طریق توالی یابی ژن dnaK

عنوان مقاله: شناسایی باکتری عامل لکه زاویه ای توسکای ییلاقی از طریق توالی یابی ژن dnaK
شناسه ملی مقاله: NCNCMB01_107
منتشر شده در نخستین همایش ملی تازه های سلولی مولکولی در سال 1391
مشخصات نویسندگان مقاله:

نسیم بافنده - دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حشمت الله رحیمیان - استاد بیماری شناسی گیاهی،دانشکده علوم زراعی،دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی،ساری
غلامرضا صالحی جوزانی - استادیار بخش بیوتکنولوژی م کیروبی و ایمنی زیستی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران(ABRII)

خلاصه مقاله:
یکی از گونه های مهم در تولید چوب گونه توسکای ییلاقی ( Alnus subcordata ) است. این گونه با داشتن قدرت تثبیت کنندگی ازت خاک و همچنین جنگل کاری برای احیای مناطق مخروبه جنگل های شمال کشور بسیار مناسب است. کی بیماری لکه برگی ناشی از گونه ای زانتوموناس در توسکا ییلاقی ( Alnus subcordata subsp. Subcordata )در جنگل های استان مازندران گزارش شده است ( 16th .1383 .Rahimian et al Iran. Plant Protec. Cong ). در این بررسی به منظور توصیف تکمیلی در جهت تعیین موقعیت تاکسونومیکی باکتری زانتوموناس عامل لکه زاویه ای توسکا از تعدادی ایزوله باکتری که قبلا با استفاده از آزمون های بیماری زایی، بیوشیمیایی و الگوی نقوش پروت یینی مورد ارزیابی قرار گرفته بودند استفاده شد.ایزوله با استفاده از پرایمر dnaK مورد مطالعه قرار گرفتند. DNA ژنومی جدایه ها به روش لیز قلیایی استخراج، PCR در شرایط توصیه شده انجام شد. محصول PCR در ژل آگارز 2 درصد الکتروفورز و با ژل رد رنگ آمیزی شد. پس از تکثیر و خالص سازی ،محصولات PCR جهت توالی یابی به شرکت BIONEER کره جنوبی فرستاده شدند. سپس با استفاده از اطلاعات موجود درNCBI و به کمک Blast مقایسه توالی ها صورت پذیرفت.توالی های بدست آمده با کمک برنامه ClustalW صف بندی و سپس در برنامه BioEdit تنظیم شدند. روابط فیلوژنتیک با استفاده از الگوریتم نزدیکترین همسایه و با کمک MEGA4 ترسیم و تفسیر گردید. ضریب اطمینان درخت ترسیم شده با محاسبه نمونه برداری مجدد بوت استراپ ارزیابی گردید.نتایج بدست آمده نشان داد که گونه مورد نظر xanthomonas arboricola می باشد.

کلمات کلیدی:
توالی یابی، باکتری زانتوموناس، تاکسونومی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/289440/