بررسی تنوع ژنتیکی در الگوی باندی ژن های حامل توالی های تکرار شوند در تعدادی از ارقام خربزه ایران

شناسائی و متمایز نمودن ارقام گیاهی بمنظور حفظ و استفاده آنها دربرنامه های اصلاحی اهمیت بالائی دارد. استفاده از تنوع موجود در مناطقکدکننده ژنوم می تواند در یافتن ارتباط میان ژنوتیپ ها و صفات اصلاحیاثر بخش باشد. ژن های مقاومت به دلیل داشتن دومین های تکرار شوندهاز اسیدهای آمینه از جمله توالی های کدکننده بشمار می روند که توالیهای تکراری متعددی را در برگرفته اند. استفاده از این تنوع میتواند درمتمایز نمودن ارقام با الگوی مقاومتی مختلف موثر باشد.در این مطالعه بمنظور بررسی تنوع تعدادی از ارقام خربزه بومی ایرانی،الگولی باندی تعدادی از ژن های کدکننده توالی های مشابه ژن هایمقاومت بنام های MRGH مورد بررسی قرار گرفت. توالی این ژن هابر اساس داده های ژنومی ملون ها از بانک های اطلاعاتی بین المللیاستحصال گردید و با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک هفت ژن MRGHانتخاب گردید و با توجه به الگولی حضور توالی های تکراری در دومینهای این ژن ها با استفاده از نرم افزار 11,VectorNTI آغازگرهایاختصاصی برای هر ژن طراحی گردید.نتایج نشان داد الگوی باندی تکثیر شده توسط این آغازگرها بین ارقاممورد مطالعه متفاوت است. در این بین توالی مربوط به دو ژن با استفادهاز آغازگرهای طراحی شده در ارقام مورد مطالعه قابل ردیابی نبود. از میانپنج ژن دیگر چهار ژن الگوی متفاوتی را میان ارقام نشان دادند. بنظرمی رسد این روش در متمایز نمودن نمونه های ژرم پلاسمی با هدفشناسائی منابع مقاومت به بیماری ها قابلیت بالائی داشته باشد. مطالعاتآتی در خصوص آنالیز توالی های تکثیر شده و بررسی ارتباط آنها با الگویمقاومتی این ارقام در برابر پاتوژن های مختلف اطلاعات باارزشی را جهتاستفاده در برنامه های اصلاحی ملون ها نمایان خواهد ساخت.

Keywords:

ملون , تنوع ژنتیکی , توالی های کد کننده تکرار شونده , ژن های مقاومت