مقایسه روشهای مورفولو ژیکی و مولکولی در شناسایی کپکها در ادویه فلفل قرمز

این تحقیق به منظور ارزیابی و مقایسه دو روش مورفولوژیکی و مولکولی در شناسایی کپک ها درادویه فلفل قرمز به عنوان یک ادویه پر مصرف در سبد غذایی مصرف کنندگان صورت پذیرفته است. فلفل قرمز تندسبزوار، به عنوان ادویه بومی استان خراسان رضوی انتخاب گردید. در ابتدا شناسایی جنس و گونه کپک ها بر پایه مشاهدات ماکروسکوپی و میکروسکوپی و بر اساس کلید های ارائه شده انجام شد. سپس تایید شناسایی جنس کپکها با استفاده از روشPCR و با استفاده از دوجفت پرایمر عمومی و اختصاصی و به دنبال آن، انجام عمل الکتروفورزصورت پذیرفت. تعیین گونه کپک های فوق با استفاده از عملSequencing تعیین توالی DNA و انجام عمل بلاستBLAST در سایتNCBI صورت گرفت. نتایج نشان داد که اغلب جنس های کپکی شناسایی شده به روش میکروسکوپی متعلق به جنس آسپرژیلوس، پنی سیلیوم، آلترناریا و رایزوپوس بوده است و در جنس آسپرژیلوس، روش میکروسکوپی بود. به دنبال انجام عمل توالی یابیSequencing در جنس آسپرژیلوس، گونه های فلاووس و توبنجنسی سو در جنس پنی سیلیوم گونه کریزوژنو مبه عنوان گونه های غالب مشخص گردید بنابرا ین گونه های آسپرژیلوس و پنی سیلیوم حاصل از مرحله توالی یابیSequencing تا حدودی با گونه های شناسایی شده به طریق میکروسکوپی اختلاف داشت. این مسئله نشان دهنده این موضوع بود که روش مورفولوژیکی نمی تواند به عنوان روشی مطمئن و قطعی در شناسایی کپک ها به کار گرفته شود و نیاز به تایید آن با استفاده از روشهای مولکولی و توالی یابی وجود دارد

Keywords:

آفلاتوکسینB1/ اکراتوکسین A/آسپرژیلوس , پنی سیلیوم/Sequencing , PCR