کاربرد نشانگر های نیمه اختصاصی در شناسایی ارقام هیبرید و لاینهای نر عقیم و نر بارور برنج

به منظور بررسی پتا نسیل نشانگرهای نشان مندکننده اینترون در انگشت نگاری ارقام و لاین های برنج ، 16DNA ژنوتیپ برنج شامل هشت هیبرید ، سه لاین نر عقیم و پنج لاین برگرداننده باروری استخراج شد و واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از 23 آغازگر نیمه اختصاصی صورت گرفت . طراحی آغازگرهای نیمه اختصاصی مورد استفاده در این تحقیق بر اساس توالی حفاظت شده پیوسته به نواحی اینترون صورت گرفت . از مجموع 23 آغازگر مورد استفاده، 12 آغازگ ر قطعات چندشکل بین ژنوتیپ ها تولید نمودند که 10 آغازگر دارای اثر انگشت منحصر به فردی بودند. دادههای مولکولی با استفا ده از تجزیه خوشه ای و بر اساس ضریب تشابه دایس خوشه بندی شدند و ژنوتیپ های مورد مطالعه در پنج گروه اصلی دسته بندی شدند . استفاده از نشانگرهای نشان مندکننده اینترون اختصاصی در شناسایی ارقام و لاین های برنج موفقیت آمیزبود، به طوری که لاین های نرعقیم سیتوپلاسمی، برگرداننده باروری و ارقام هیبرید را از هم متمایز نم ود. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگر نشان مندکننده اینترون (IT) با تکرارپذیری بالا یک روش مفید برای انگشت نگاری DNA بوده و از الگوی نواربندی حاصل از آن میتوان در آزمون خلوص ژنتیکی هیبریدهای برنج استفاده نمود.

Keywords:

انگشت نگاری , نشانگر نیمه اختصاصی و برنج