سعید میرزایی - گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی ، پژوهشگاه علوم، تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته
پیتر گرشف - مرکز تحقیقات حبوبات، دانشگاه کوئینزلند

ژن CLAVATA1 (CLV1) در گیاه مدل آرابیدوپسیس نقش بسیار مهم و کلیدی در نگهداری سلول های بنیادی نوک شاخه و ریشه بازی می کند. در گیاه سویا دو ژن GmCLAVATA1A (GmCLV1A) و GmNARK ژنهای با تشابه بسیار بالا با CLV1 هستند. ژن GmNARK در سویا نقش اساس ی در کنترل غده زایی از طریق فرایند Autoregulation of Nodulation بازی می کند. ولی نقش ژن GmCLV1A که تشابه بالایی با GmNARK (در حدود 92 درصد) دارد در ریشه مشخص نیست . در این مطالعه تراسکریپتوم نوک ریشه موتانت Gmclv1a و تیپ وحشی با روش جدید RNA-Seq یا همان deep sequencing مقایسه شد تا اطلاعاتی را بروی نقش این ژن در ریشه فراهم آورد. نوک ریشه بعد از 48 ساعت بعد از حوانه زنی در تاریکی برداشت گردید. حدود 1204 ژن بیان متمایزی از خود نشان دادند که در این میان 777 ژن افزایش و 427 ژن کاهش بیان را نوک ریشه Gmclv1a نشان دادند. آنالیز MAPMAN نشان داد که بسیاری از این ژن ها در مسیر های مولکولی متابولیسم ، سیگنالینگ و توسعه نقش دارند.

سویا، ترانسکریپتوم، نوک ریشه، RNA-seq ، لگوم