طراحی روش LAMP برای تشخیص سریع بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBL) خانواده CTX-M_1

مقدمه: باکتری های مولد (ESBL) Extended Spectrum Beta Lactamaseعامل عفونت های شدید از جمله عفونت های بیمارستانی، عفونت داخل شکمی، باکتریمی، عفونت های دستگاه ادراری وعفونت های دستگاه تنفسی محسوب می شوندCTX-M-1 یکی از مهمترین ژن های مولدESBLsمی باشد. تشخیص ژن های کد کنندهESBLsبا روش های مختلف فنوتیپی و ژنوتیپی انجام می شود.اخیرأ روش تکثیر هم دمای وابسته به حلقه(LAMP) Loop Mediated Isothermal Amplificationبا کارایی و سرعت بالا،اهمیت زیادی در تشخیص عوامل عفونی پیدا کرده استهدف: هدف از این مطالعه طراحی و راه اندازی روشLAMPبرای تشخیص سریع مولدینESBLنوعCTX-M-1 می باشد. روش: ترادف ژن های مربوط به خانوادهCTX-M-1ازGene bankاستخراج و هم ردیف سازی گردید. با استفاده از ترادف Consensusحاصل، پرایمرهای اختصاصیLAMPطراحی شد. استخراجDNAاز تعدادی جدایه کلینیکی مربوط به باسیل های گرم منفی روده ای که تولیدESBLتوسط آن ها با روش فنوتیپی و روشPCRتأیید شده بود، انجام گرفت.نمونه های استخراج شده، درواکنشLAMPدر شرایط استاندارد و در حضور پرایمرهای اختصاصی طراحی شده، بررسی شدند.

Keywords:

مقاومت چند دارویی , بتالاکتاماز وسیع الطیفESBL , واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR , تکثیر هم دمای وابسته به حلقه LAMP و CTX-M-1