احسان پورعابد - بخش زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
زهراسادات شبر - بخش زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
فرزان قانع گل محمدی - بخش زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران
منظر حیدری - بخش زیست شناسی سیستمها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران

برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی میباشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و ترسیم تصویر روشنتری ازنحوه پاسخدهی گیاه برنج به تنش خشکی و شناسایی ژنهای کلیدی مربوطه با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایهMicroarray بوده است. به همین منظور دادگان آرایهGEO از GSE26280 ازGEOپایگاه دادهNCBIدانلود شد. در این آزمایش الگوهای بیان ژنها در برگ و ریشه در مرحله پنجه زنی و افزایش طول پانیکل و برگ و پانیکل جوان در مرحله خوشه دهی با اعمال تنش خشکی به وسیله قطع آبیاری RWC = 65%- 75%)با استفاده از یک لاین متحمل به خشکی به نامDK151شناسایی شد. نرمال سازی دادههای این آزمایش توسط الگوریتمRMAصورت گرفت. در مجموع 1806 ژن با تغییر بیان ≥ 5 و ≤ 5 - شناسایی شد و شبکه برهمکنش پروتئینی برای آنها رسم گردید. با استفاده از 11 الگوریتم محاسباتیCytohubbaدر نرمافزارCytoscapeتمامی ژنها با بیشترین برهمکنش به دست آمد. این امرمنجر به شناسایی 26 ژن غیر تکراری شد که به عنوان مؤثرترین ژنها در نظر گرفته شدند و شبکه همبیانی آنها در هر دو جهت مثبت و منفی در محدوده نسبت همبستگی بین0/6تا0/9رسم گردید. در مجموع، عوامل رونویسی بیشترین تعداد را در بین 26 ژن مؤثر وژنهای همبیان با آنها دارا بودند که نشان دهنده اهمیتشان در مکانیسم تحمل به خشکی میباشد

برنج، تنش خشکی، ریزآرایه، شبکه برهمکنش پروتئینی، شبکه همبیانی ژنی