بررسی فیلوژنی قارچTrichoderma harzianumجدا شده از برخی اقلیم های ایران

از جمله جنس های قارچیTrichoderma است که قادر به رشد در بسترهای متنوع می باشد. همین خاصیت همه جازی بودن، آن را به عنوان قارچی با قابلیت ایفاء نقش مهمی در زندگی بشر مطرح ساخته است. از جمله خصوصیات مهم برخی گونه های این جنس تولید آنتی بیوتیک ها و آنزیم ها است، که آنها را قادر به کنترل بیولوژیک بیمارگرهای گیاهی می نماید. گونهT. harzianumاز جمله فراوان ترین گونه های این جنس است که دارای کاربرد فراوانی در کنترل بیولوژیک می باشد. نظر به تاثیر بسزای این گونه بر فعالیت های بشر،این تحقیق با هدف بررسی ساختار فیلوژنتیکی گونه کمپلکسT. harzianumو به منظور کمک به روشن تر شدن حدود و ثغورتاکسونومیکی و فیلوژنتیکی آن در کشور انجام گرفت. طی سال های 1389 و 1390 نمونه برداری از مناطق جغرافیایی مختلف واقع در برخی اقلیم های کشور، و از سوبستراهای متنوع شامل خاک، کلاهک و ریزومرف قارچArmillaria spفیلوسفر و چوب های پوسیده در اکوسیستم های متفاوتی از قبیل مزارع، باغات، جنگل ها، گلخانه ها و نیز خزانه توتون انجام گرفت. تعدادی جدایه نیز از خاک، بسترقارچAgaricus bisporusو بقایا و فیلوسفر برنج مربوط به نمونه برداری سال های 1385 تا 1388 از سایر محققین دریافت و در این تحقیق به کار برده شدند. درمجموع، 239 جدایهTrichodermaبه دست آمد. پس از شناسایی مرفولوژیک، غربال اولیه جدایه ها بااستفاده از روشRAPD-PCRانجام گرفت، و بر اساس گروه بندی انجام شده، تعدادی از جدایه ها به عنوان نماینده جهت توالی یابی نواحیs و ITS2 ،ITS5.8 انتخاب شدند. شناسایی مولکولی گونه ها بر اساس توالی نوکلئوتیدی این نواحی و با استفاده از برنامهTrichOKey v. 2.0انجام گردیددر مواردی که شناسایی دقیق گونه بر اساس توالی ناحیهITSمیسر نبود، شناسایی به کمک تعیین توالی بخشی از ناحیه ژنیtef1 انجام گرفت.

Keywords:

فیلوژنی , tef1 , ITS , فیلوتیپ , الل