بررسی روابط فایلوژنی جمعیتهای دو گونه مهم باربوس ماهیان استان خوزستان باmtDNAبه روش PCR- Sequencing
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 853
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0385
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
Abstract:
هدف از اجرای این مطالعه بررسی ناحیه سیتوکروم اکسیداز(COI) I ازDNA میتوکندریاییmtDNA گونه یاBarbus grypusشیربت و گونهBarbus barbulus برزم لب پهن) جهت انجام مطالعات ژنتیکی و فیلوژنتیکی بود. تعداد 30 نمونه از گونه از 4 جمعیت رودخانه کارون در اهواز، مزارع، رودخانه کارون در شوشتر و رودخانه جراحی در شادگان) از گونهBarbus grypusو تعداد 32 نمونه از این گونه از 3 جمعیت ( رودخانه کارون در اهواز، رودخانه کارون در شوشتر و رودخانه جراحی در شادگان) از گونهBarbus barbulus جمعآوری گردید. پس از استخراج DNAتکثیر ناحیه سیتوکروم اکسیداز I ازDNA میتوکندریایی به طول تقریبی 650-660 جفت باز به کمک جفت پرایمرهایCOI-625 R و COI-625 Fصورت گرفت. تعداد 34 نمونه محصولات PCRتوالییابی شدند. این توالیها به کمک برنامه هایArlequin و 3.5 MEGA5 ،BioEdit5.0.9مورد بررسی قرار گرفت. میانگین تنوع نوکلئوتیدی درون 4 جمعیت گونه شیربت بترتیب 0/004 و0/006و0/055و0/004نشان داده شد. میانگین تنوع نوکلئوتیدی درون 3 جمعیت گونه برزم لب پهن بترتیب0/022و0/021و0/046 نشان داده شد. این نتیجه نشاندهنده تنوع نوکلئوتیدی پایین در درون جمعیتهای این گونه ها است. درخت فیلوژنتیک آنها براساس ماتریس فاصله ژنتیکی با روشUPGMAبا برنامهMEGA5 رسم شد که نشان داد بین گونه برزم لب پهن و شیربت فاصله ژنتیکی وحود دارد. سهم عمده تنوع در جدول تجزیه واریانس مربوط به بین جمعیت ها درون گونه ها59/4درصداست وکمترین تنوع مربوط به درون جمعیت ( 4 درصد) است که نشاندهنده شباهت بالای داخل جمعیتها در داخل گونهها است. این نتایج برای حفظ تنوع ژنتیکی این گونه در سطح مناسب، پیشنهاد میدهد از مولدهای جدید بیشتر درون جمعیتها استفاده شود.
Keywords:
Authors
علیرضا دارابی
دانشجوی مقطع دکتری رشته ژنتیک و اصلاح نژاد دام، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران
ناصر امام جمعه کاشان
گروه مدیریت کشاورزی، دانشکده کشاورزی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی
جمال فیاضی
گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین
مهدی امین افشار
گروه مدیریت کشاورزی، دانشکده کشاورزی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :