بررسی ژنهای دخیل در سنتز مونوترپنها در گیاهان و ریزسازوارهها

تیمول یک مونوترپن فنولی است که دارای 3 گروه متیل، یک حلقه بنزنی و یگ گروه هیدروکسیل با فرمول شیمیایی باشد. مونوترپنها از مسیرMEPسنتز میشوند. در این مطالعه توالیهای اسیدآمینهی مربوط به آنزیمهای مسیر تولید مونوترپنها از پایگاه اطلاعاتیNCBIدریافت شد و توالیهایی دیگر نیز از پایگاه اطلاعاتیphytozomeبا استفاده از بلاست توالیهای ژنهای3DXR ، 2DXSوCYP ، 10TPS ، 9GDS ، 8 HDR ، 7HDS ، 6MDS ، 5CMK ، 4MCT مسیر تولید مونوترپنها در آرابیدوپسیس علیه ژنوم گیاهان باقیمانده صورت گرفت. همردیفی 12 توالیهای پروتئینهای بدست آمده با استفاده از نرمافزارClustalWانجام شد، و در نهایت با استفاده ازنرمافزارMEGA4 و با روش نزدیکترین همسایگی 13 و با بوت استرپ 100 رابطه فیلوژنی مربوط به توالیها رسم شد. درخت فیلوژنی ژنDXSدخیل در مسیر بیوسنتزی مونوترپن در 27 گونه گیاهی و ریزسازوارهها رسم شده است، که این درخت فیلوژنی مربوط به 20 گونه گیاهی و 6 گونه باکتریایی و 1 گونه مخمر میباشد، که این گونهها در هشت گروه مجزا قرار میگیرند که در آن توالیهای مربوط به گیاهان در دو گروه قرار گرفتهاست و توالیهای مربوط به باکتریها در پنج گروه تقسیمبندی شدهاند و مخمر Saccharomyces cerevisiae در گروه مجزا قرار گرفته شدهاست. برخی از گونههای گیاهی دارای چندین ایزوفرم از ژن میباشند

Keywords:

تیمول , مونوترپن , MEP , درخت فیلوژنی