بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYB

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYBتوالی 10 آیزوفرم مختلف از آرابیدوپسیس از پایگاه NCBI تهیه شد که شاملMYB29 MYB28-2, MYB28-1, MYB27, MYB26, MYB25, MYB23, ,MYB22, MYB2 بودند کهتوسط برنامهGENE INFINITYمورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج نشان داد که برای اکثر اسید آمینهها، کدونی ترجیح داده شده بودکه نوکلئوتید انتهایی آنAیاtبود و برعکس برای همان اسید آمینهها کمترین ترجیح برای کدونهایی بود که دارایcیاG درنوکلئوتیدآخر خود بودند. نتایج حاصل از تجزیه کلاستر نشان داد که در گروه اول که شاملMYB23, MYB29, MYB28-2, MYB28-1وMYB20بودند بین آیزوفرمMYB28- و 2 MYB28-1بیشترین تشابه ( 63,35 %) از لحاظ ترجیح کدونی وجود داشت در حالیکه در گروه دوم که شاملMYB27, MYB25 ,MYB26 ,MYB22 MYB2می شود و بین آیزوفرمMYB و 22 MYB2561 ) بیشترین تشابه از لحاظ ترجیح کدونی وجود داشت. بنابراین میتوان نتیجه گرفت که بین آیزوفرمهای مختلف این ژن از نظر ترجیح کدونی شباهت وجوددارد

Keywords:

ترجیح کدونی , MYB , آیزوفرم