CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

شناسایی متغیرهای مهم در ژنوتیپ های یک و دو ویروس هپاتیت سی با استفاده از الگوریتم های آماری وزن دهی

عنوان مقاله: شناسایی متغیرهای مهم در ژنوتیپ های یک و دو ویروس هپاتیت سی با استفاده از الگوریتم های آماری وزن دهی
شناسه ملی مقاله: CIGS13_0620
منتشر شده در اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:

نجمه تقی زاده - دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه فنی و مهندسی، دانشکده کامپیوتر، دانشگاه قم، قم، ایران
منصور ابراهیمی - گروه زیست شناسی و گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم، قم، ایران
امیرحسین کیوان جو - گروه زیست شناسی و گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم، قم، ایران

خلاصه مقاله:
ویروس هپاتیت سیHCV یکی از مهمترین علل عفونی تهدید کننده سلامتی در سراسر جهان است که نوع درمان و طول درمان وهزینه های درمان هپاتیتC بستگی به ژنوتیپ ویروس دارد از این جهت تعیین وشناسایی نوع ژنوتیپ از اهمیت بالایی برخوردار هست. این مطالعه از الگوریتم های مختلف وزن دهی به منظور شناسایی متغیر های مهم نوکلئوتیدی در بین ژنوتیپ های یک و دو ویروسهپاتیت سی انجام شده است. دیتابیس اولیه که داری 78 ویژگی است و با تمیزکردن به 23 تا کاهش می یابد. که با اجرای 10 الگوریتم روی آن به 10 دیتابیس دیگر دست پیدا کردیم که یکی از آنها درخت تصمیم با تعدادی ویژگی است. نتایج حاصله نشان داد که اسید آمینهگوانین به تنهایی یا در ترکیب با سیتوزین به عنوان مهمترین متغیرهای ژنی جهت تمایز ژنوتیپ های یک و دو ویروس هپاتیت سیمشخص گردیده است. فراونی گوآنین (حداکثر آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,29 و 0,285 و میانگین آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,28 و 0,27 ) و فراوانی سیتوزین -گوآنین (حداکثر آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,068 و 0,063 و میانگین آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 0,063 و 0,055 ) و تعداد سیتوزین-گوآنین (حداکثر آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 927 و 730 و میانگین آن در ژنوتیپ 1و 2 به ترتیب 592,8و 529,3 ) به عنوان مهم ترین عوامل در تفاوت ساختاری ژنوتیپ های یک و دو شناسایی شدند. برای اولین بار نشان داده شد که فراوانی گوانین می تواند به عنوان یک شاخص مهم در شناسایی دو ژنوتیپ ویروس هپاتیت سی مورد استفاده قرار گیرد

کلمات کلیدی:
داده کاوی، هپاتیت سی، ژنوتیپ 1و 2، وزن دهی صفات

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/328290/