عاطفه امیری - گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد
علی محمد احدی - گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد
هدی آیت - گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد

بیماری ایدز در عصر حاضر یکی از معضلات اساسی جوامع انسانی است که با وجود تحقیقات گسترده، درمان آن همچنان یک فرآیند زمانبر و البته پرهزینه است. ماهیت ویروسی این بیماری، متغیر بودن پروتئینهای ساختاری این ویروس و تکثیر آن در سیستمایمنی، ضرورت ساخت یک واکسن مناسب را توجیه میکند. هدف اصلی این مطالعه، معرفی روشی جدید جهت طراحی یک پروتئین الحاقی نوترکیب است، تا بتوان از آن به عنوان یک واکسن مؤثر علیهHIVویروس نقص ایمنی انسان استفاده کرد. در این مدلسازی، ما دو پروتئینgp120پروتئین سطحی ویروسCD و 4 (HIV گیرندهی gp120 در سیستم ایمنی) را با یک لینکر غیرقابل انعطاف، توسط نرمافزارchimeraبه هم متصل کردیم.ساختار ثانویه و انرژی ثبات این ساختار جدید هم مورد بررسی قرار گرفت نتایج نرمافزارهای مدلسازی و نیزYASARAکاربردی بودن ساختار الحاقی جدید برای ساخت یک پروتئین نوترکیب را تأییدکردند. در گام بعدی با استفاده از سرورهایABCpred و ProPredو بر اساس خواص آنتیژنیکی قابل تشخیص توسط ایمنی هومورال و سلولی، اپیتوپهای موجود در پروتئین نیز پیشگویی شدنتایج ما نشان داد که تعدادی موتیف محافظت شده درgp120 وجود دارد که میتوانند گزینههای مناسبی برای ساخت یک واکسن نوترکیب باشند .به علاوه اتصال یک لینکر غیرقابل انعطاف و نیز دومینCD 4 به gp120 میتواند موجب افزایش خاصیت آنتی ژنیک این واکسن نوترکیب شود

ایدز، واکسن نوترکیب، مدلسازی