مشخص شدن ژنهای موثر در یادگیری و حافظه در سگسانان و آنالیز پروموتر آنها

هدف تحقیق پیدا کردن ژنهای مرتبط با یادگیری و حافظه در سگسانان و آنالیز نواحی پروموتور این ژنها می باشد. جهت دستیابی به هدف فوق ابتدا دادههای زیستی و متون علمی موجود در حیوانات دیگر بررسی شده و سپس پروتئین این ژنها در سگ و همچنین انسان از پایگاه دادهUniProtاستخراج شد. اما از آنجا که صرف تشابه پروتئینها نشاندهنده عملکرد یکسان آنها نیست، با انجام آنالیزهایی درپایگاههای اطلاعاتیPsort ،Quick Go ،KEGG ،Interproبه بررسی و مقایسه این پروتئینها از نظر خانواده پروتئینی، دومینها فرایندهای بیولوژی، عملکرد مولکولی، موقعیت سلولی و مسیرهای متابولیسمی پرداخته شد. نتیجه تحقیق نشان داد که تعدادی از این پروتئینها در رت (موش)، سگ و انسان عملکرد یکسانی دارند. به این ترتیب پیشبینی میشود که ژن کدکننده این پروتئینها در یادگیری و حافظه در سگ موثر باشند. سپس بیان این ژنها در ناحیه هیپوکمپوس سگ، براساس اطلاعات موجود درGEO profileبررسی شد واطلاعات موجود نشان داد که سه ژنTac و 1 cck ،BDNFدر هیپوکمپوس سگ بیان میشوند و بنابراین در میان ژنهای پیشبینی شده این سه ژن میتوانند ژنهای کاندیدای قوی مرتبط با یادگیری و حافظه در سگ باشند. به منظور آنالیز سطح بیان سه ژنcck ،BDNF,Tac1آنالیز پروموتر با استفاده ازMATCH و TESSصورت گرفت و متیلاسیون ناحیه پروموتری در هر سه ژن مورد بررسی قرار گرفت نتایج نشان داد که ناحیه قرارگیری فاکتور رونویسیHNF- 4 در ژنBDNFو سایت آغاز رونویسی در ژنcckدر معرض متیلاسیون قرار دارند.

Keywords:

سگ , یادگیری و حافظه , پروموتر , بیوانفورماتیک