بررسی میانکنشVHH و HER2شتری و اسیدآمینه های در گیر در میانکنش
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 562
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0821
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
Abstract:
تومورمارکریHER2 است که در سلول های توموری بخصوص سرطان پستان و تخمدان افزایش بیان دارد و موجب افزایش پتانسیل متاستازی سرطان پستان شده، با کاهش بقای بیمار در ارتباط است. تحریک پاسخ ایمنی بر ضدHER2می تواند موجب توقف رشد توموردر بیماران سرطانی با افزایش بیانHER2شود. در ابتدای دهه 90 ، مجموعهای از آنتی بادیهای مونوکلونال برضد دمین خارج سلولی HER2به منظور جلوگیری از عمکرد سیگنالی آن طراحی شدVHH.نانوبادی) آنتیبادی یافت شده در سرم شترسانان بوده که فاقد زنجیره سبک می باشد. هدف از انجام این مطالعه بررسی میانکنش بینHER2و دو آنتی بادیVHHاختصاصی آن از طریق یکسری نرم افزارها و یافتن راه حلی برای افزایش تمایلVHHهای طراحی شده علیه این آنتی ژن می باشد. در ابتدا توالی کدکننده پروتئین ها از پایگاه اطلاعاتیNCBIو ساختار سه بعدی آن از سرورphyre2 بدست آمد. سپس بخش خارج سلولیHER2با کمک سرورPRED-TMBBمشخص شده و با استفاده از نرم افزارContextبه صورت منفرد ایجاد شدDockingدو آنتی بادیVHHبا بخش خارج سلولیHER2به کمک نرم افزرHex 5.1 انجام شد. نتیجه به صورت فایلpdbدر نرم افزارYASARAبررسی شد. اسیدهای آمینه درگیر در میانکنش بین آنتی بادی ها و آنتی ژن، جایگاه قرارگیری این اسیدآمینه ها در آنتی بادی، اتم های شرکت کننده در تشکیل پیوند، نوع پیوندها و همچین فاصله پیوندی آنها مشخص شد
Keywords:
Authors
زهرا حسن پور
دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد
هدی آیت
عضو هیئت علمی گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد
علی محمد احدی
عضو هیئت علمی گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :