بررسی بیوانفورماتیکی ژن 1-دئوکسی-دی -زایلوز 5-فسفات سنتاز در چندین گونه گیاهی به منظور جداسازی ژن در پیرتروم
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 792
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_1181
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
Abstract:
ژن 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات سنتاز 1یک ژن کلیدی در مسیر بیوسنتزی ایزوپرنوئیدها 2 می باشد که این ژن در مسیرMEPبا استفاده ازپیروات و گلیسر آلدهید 3 -فسفات باعث تولید 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات 4 می گردد. با توجه به اهمیت بالای ایزوپرنویید ها بررسی وشناخت بیشتر این متابولیتها حائز اهمیت میباشد. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی توالی نوکلوتیدی مربوط به ژن مزبور وطراحی آغازگر به منظور جداسازی این ژن در گیاه پیرترومcinerariaefolium Chrysanthemum)از خانواده گل ستاره ای ها 5 میباشد در این تحقیق ابتدا توالی های نوکلوتیدی آنزیم 1-دئوکسی-دی-زایلوز 5-فسفات سنتاز از پایگاه اطلاعاتیNCBIدریافت شد و سپس توالی های دریافت شده توسط نرم افزار تحت وبClustalWهمردیف شدند و درخت فیلوژنی آن توسط نرم افزارMEGA4رسم و مورد بررسی قرار گرفت. از همردیف سازی توالی های بدست آمده برای این توالی در گیاه پیرتروم آغازگرهای ویژه مستقیم و معکوس طراحی و ساخته شد. نتایج واکنش زنجیره ای پلیمراز و مشاهده باند با طولbp715 نشان داد که آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای جداسازی ژنDXSکارایی لازم را دارند.
Keywords:
Authors
سیدمحمد دبیری
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی در کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
محمد مجدی
عضو هیئت علمی گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
بهمن بهرام نژاد
عضو هیئت علمی گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :