بررسی شبکه هم بیانی ژنSOS1 با استفاده ازGeneCAT
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 937
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_1265
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
Abstract:
ژن ها در یک مسیر زیستی اغلب به صورت جمعی بیان می شوند و ینابراین اطلاعاتی در مورد هم بیانی کلیدی جهت درک سیستم های بیولوژیکی است. تجزیه ریزآرایهDNAاطلاعاتی را در مورد بیان نسبی هزاران ژن به طور همزمان تولید می کند. چنین داده های ریزماهواره ای در مخزن هایی جمع آوری شده استGeneCAT.یک جعبه ابزار آنالیز هم بیانی ژن است که دربردارنده چندین ابزارجدید تجزیه کننده اطلاعات ریزآرایه است. در آرابیدوپسیس تالیانا، جایگاه ژنSOS1برای تعادل یون سدیم و پتاسیم مهم میباشد و این ژن در محیط به بازدارندگی رشدی از طریق بالارفتن سدیم و پایین آمدن پتاسیم حساس است. هدف از این مطالعه بررسی شبکه همبیانی ژنSOS1 در گیاه آرابیدوپسیس و همچنین میزان بیان این ژنها در مراحل مختلف رشد و بررسی عناصر تنظیمی ژنSOS1 میباشد. نتایج نشان داد از لحاظ روابط فیلوژنتیکی ژنSOS1با ژن با شناسهAt1g34400روابط خویشاوندی نزدیکی دارد و درنتیجه بیشترین میزان همبستگی را دارند. هم چنین دو عنصر تنظیمیG-Box و ABREاین ژن را تنظیم میکنند. و بیشترین میزان بیان این ژن در مراحل ریشه ای، گیاهچهای و تشکیل بذر بوده است. این نتایج اطلاعاتی را در اختیار قرار می دهد تا مسیرهای پیچیده در واکنش به تنش را بهتر بررسی کنیم
Keywords:
Authors
فریبا قادری
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات
فرانگیز قادری
دانشیارگروه اصلاح و بیوتکنولوژی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سیروان سعیدی آذر
دانشیارگروه اصلاح و بیوتکنولوژی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سیدکمال کاظمی تبار
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :