CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیز فیلوژنتیکی ژن Cylindrical Inclusion ویروس موزائیک زرد کدو جدایه استان مازندران

عنوان مقاله: آنالیز فیلوژنتیکی ژن Cylindrical Inclusion ویروس موزائیک زرد کدو جدایه استان مازندران
شناسه ملی مقاله: BSCONF01_125
منتشر شده در اولین کنگره ملی زیست شناسی و علوم طبیعی ایران در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:

حسینعلی میرحسینی - دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حشمت اله رحیمیان - استاد گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
ولی اله بابایی زاد - استاد یار گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سحر نوری - دانشجوی دکتری بیماری شناسی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

خلاصه مقاله:
ویروس موزائیک زرد کدو Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) از جنس پوتی ویروس یکی از عوامل مهم محدود کننده محصولات کدوئیان در ایران میباشد. ناحیه Cylindrical Inclusion (CI) این ویروس که مختص به پوتی ویروسها است، نقش بسزایی در رونویسی ویروس و حرکت سلول به سلول دارد. در ابتدا از مناطق مختلف جالیزکاریهای شهر ساری در استان مازندران نمونه برداری صورت گرفت، سپس آلودگی نمونه ها به ویروس با انجام تست الایزا تایید شد. به منظور بررسیهای مولکولی، استخراج آر ان ای انجام شد وبه دنبال آن، cDNA ی ویروس با تکنیک RT-PCR ساخته شد. ناحیه مورد نظر جدایه نماینده به وسیله جفت آغازگرهای اختصاصی (CIFor و CIRev) به وسیله واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) تکثیر شد. پس از تعیین توالی و همردیف سازی نوکلئوتیدها، این توالی با استفاده از برنامه بلاست با دیگر توالیهای موجود در بانک ژن مقایسه گردید. بررسی ارتباط فیلوژنتیکی این جدایه با دیگر جدایه ها و ترسیم درخت فیلوژنتیکی با برنامه MEGA موید بیشترین شباهت این جدایه با جدایه Gj1 از استان خراسان، هم از لحاظ ترادف نوکلئوتیدی و هم آمینو اسیدی بود. این اولین بررسی و تعیین ترادف ناحیه CI از ژنوم ویروس موزائیک زرد کدو جدایه استان مازندران میباشد..

کلمات کلیدی:
آنالیز فیلوژنتیکی، اندامک های همراه استوانه ای، ویروس موزائیک زرد کدو

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/333041/