CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

استفاده از الگوریتم کامبت با رابط موازی سازی Open Mp برای مطابقت در رشته های DNA

عنوان مقاله: استفاده از الگوریتم کامبت با رابط موازی سازی Open Mp برای مطابقت در رشته های DNA
شناسه ملی مقاله: EMAA01_136
منتشر شده در همایش الکترونیکی پژوهش های نوین در علوم و فناوری در سال 1393
مشخصات نویسندگان مقاله:

میلاد قاسمزاده - دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه کامپیوتر، دانشگاه بین المللی امام رضا (ع)، مشهد
نجمه فیل اللهی - دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه کامپیوتر، دانشگاه بین المللی امام رضا (ع)، مشهد
عبدالرضا سوادی - استادیار، دانشکده مهندسی، دانشگاه فردوسی، مشهد

خلاصه مقاله:
در این مقاله سعی دارد تا با استفاده از الگوریتم موازی در سطح DNA پروتئین برای مطابقت در رشته های DNA را مورد بررسیقرار دهد، و یک الگوریتم جدید به نام کامبت 1 که زاتا یک الگوریتم سریال است را به نحوه ی که در ادامه به شرح آن می پردازد، کهقسمتی از الگوریتم را به صورت موازی با رابط موازی سازی Open Mp پیاده سازی کند. تا با استفاده از آن بتواند مطابقت رشتههای DNA در سطح DNA پروتئین از لحاظ Speed-up نسبت به الگوریتم های دیگری، که به حالت ایده آل نزدیک تر باشد را ارائهکند و مقایسه الگوریتم مذکور را با تعداد پردازنده های متفاوت را مورد بررسی قرار دهد.

کلمات کلیدی:
الگوریتم موازی ، رشته های DNA ، کامبت ، Open Mp ، Speed-up

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/365052/