پیش بینی تولید استات توسط اشریشیاکلی با استفاده از یک مدل متابولیکی مقیاس ژنوم
Publish place: 15th Iranian Natioanl Congress of Chimical Engineering
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 910
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICHEC15_505
تاریخ نمایه سازی: 19 تیر 1394
Abstract:
با مدل سازی و شبیه سازی عملکرد یک ریزاندامگان می توان به راهکارهای بهبود عملکرد سلول دست یافت. دراین تحقیق، با استفاده از ادغام داده های بیان ژن با یک مدل متابولیکی مقیاس ژنوم، یک الگوریتم به منظور پیش بینی تولید استات و یافتن ژن های موثر در تولید آن توسط اشریشیاکلی ارائه شده است. الگوریتم تولیداستات را در بازده رشد بین0/5و0/18 پیش بینی می کند و به خوبی می تواند محدودیت های منجر به تولید استات را شناسایی نماید. نتایج الگوریتم نشان می دهد که افزایش بیان سه ژنdld و nfsB ،ndhاز مسیر فسفریلاسیون اکسیداتیو بیشترین نقش را در کاهش تولید استات دارد. همچنین کاهش بیان ژن های ompFوnfsB و lamB ،ompC موثرتر از سایر ژن ها در کاهش تولید استات است
Keywords:
Authors
منا حیدری
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده مهندسی شیمی - دانشگاه تربیت مدرس - تهران، ایران.
احسان معتمدیان
استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده مهندسی شیمی- دانشگاه تربیت مدرس - تهران، ایران.
سیدعباس شجاع الساداتی
استاد گروه بیوتکنولوژی، دانشکده مهندسی شیمی - دانشگاه تربیت مدرس- تهران، ایران.
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :