آنالیز فیلوژنتیکی تعدادی از جدایه های ایرانی ویروس موزائیک یونجه

به منظور شناسایی و تعیین جایگاه تکاملی برخی از جدایه های ایرانی ویروس موزائیک یونجه (AMV) از مزارع سیب زمینی گوجه فرنگی، فلفل، نخود، لوبیا و علف های هرز مزارع یونجه چندین استان کشور تعداد 775 نمونه جمع آوری شد و توسط آزمون سرولوژیکی ELISA مورد بررسی قرار گرفتند. در مجموع تعداد 17 نمونه آلوده به این ویروس شناسائی گردید. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی جدایه های مذکور در نقاط مورد مطالعه، ژن پوشش پروتئینی به اندازه 780 جفت باز با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی در روش RT-PCR تکثیر و سپس همسانه سازی شد. پس از همسانه سازی و تعیین ترادف ژن مذکور، جایگاه تکاملی جدایه های ایرانی در مقایسه با ترادف های موجود در بانک جهانی ژن تعیین گردید. نتایج حاصل بیانگر آنست که غیر از جدایه Ke. Ma. Pl سایر جدایه های ایرانی در گروه ІІ قرار می گیرند. در صورتیکه جدایه Ke. Ma. Pl در شاخه ای مجزا از سایر جدایه های ایرانی و جدایه های موجود در بانک ژن قرار می گیرد. درصد تشابه نوکلئوتیدی بین جدایه ها به میزان 99/8- 73/2% می باشد بطوریکه بیشترین میزان شباهت بین جدایه K2703 از کشور آمریکا و جدایه های ایرانی Ke. Or. Am و Ke. Si. Ru و کمترین میزان تشابه مربوط به جدایه AF294432 از کشور کره جنوبی با جدایه Ke. Ma. Pl مشاهده شد.

Keywords:

ژن پروتئین پوششی , ویروس موزائیک یونجه , درخت فیلوژنتیکی