تعیین ترادف ژن های جدایه ایرانی ویروس V سیب زمینی

به منظور مطالعه ژنوم کامل ویروس V سیب زمینی (PVV) و مقایسه جدایه ایران ی ای ن وی روس با تنها جدایه گزارش شده در دنیا، یک نمونه آلوده به این ویروس با علائم موزائیک و ایجاد لکه های نکروز در سطح برگ ها از به وس یله آزمون الا ی زا PVV مزارع کشت سیب زمینی در منطقه بردسیر کرمان جمع آوری و آلودگ ی آن بهNicotiana با آنتی سرم چند همسانه ای تائید شد. پس از آن جدایه مذکور بر روی توتون ها ی رقم (ELISA) تکثیر گردید. آر.ان.ای این جدای ه استخراج و با کمک Nicotiana tabacum var. samsun NN. و debneyii 1368 و ، 1074 ،156 ،1902 ،156 ،564 ،738 ،1557 ، جفت آغازگرهای اختصاصی قطعات ی ب ه طول های 816NTR و ناحی ه HC-Pro ,P3 ،6k1 ،CI ، ،6k2 ،VPg ،NIa ,NIb ,CP 340 جفت باز به ترتیب مربوط به ژن های استرین Escherichia coli جهت همسانه سازی با کمک باکتری RT-PCR 3′ ویروس تکثیر شد. از محصولات استفاده شد. پس از تعیین ترادف نوکلئوتیدی و اسید های آمینه، ترادف ژن های مذکور pTZ و پلاسمید XL-blue(DV با تنهاجدایه گزارش شده از کشور اسکا تلند موجود در بانک ژن : 42 DNAMAN با استفاده از نرم افزار و P3 ،6k2 ،CI ،VPg ،6k1 ،NIa ،NIb ،CP مقایسه شدند. در این مقایسه ژن های Accession no AJ243766) 84 درصد / 93 و 1 /6 ،94/8 ،93 ،95/7 ،91/5 ،94 ،92/8 ،96/ به ترتی ب 4 DV جدایه ایرانی و جدایه 42 HC-Pro85 در صد برای ترادف اسید های / 97 و 2 /2 ،100 ،98/5 ،93،100/5 ،95/2 ،94/2 ،96/ برای ترادف نوکلئوتیدی و 6 96/2 در صد تعیین گردید. این نتایج بی انگر 3′ NTR آمینه شباهت داشتند. میزان تشابه ترادف نوکلئوتیدی ناحیه آن است که دو جدایه ایرانی و اسکاتلندی از نظر میزان ترادف نوکلئوتیدی نزدیک به هم هستند.

Keywords:

سیب زمینی , تعیین ترادف ژنی V ژنوم کامل , ویروس