همسانه سازی ژن پروتئین پوششی و تعیین جایگاه تکاملی دوجدایه های ایرانی ویروس سیب زمینی X

یکی از عوامل مهم که در سیب زمینی موجب خسارت می شود ویروس x سیب زمینی (PVX) می باشد. این ویروس از جنس Potexvirus با پیکره های ایزومتریک و ژنوم RNA تک لا و مثبت می باشد. در این بررسی تعداد 150 بوته دارای علائم ویروسی از مزارع سیب زمینی استان های کرمان، اصفهان، یزد و هرمزگان نمونه با استفاده از آزمون ساندویچ الایزا مورد بررسی قرار PVX برداری شد. نمونه ها ابتدا با آنتی سرم اختصاصی گرفتند. از بین نمونه های مثبت دو جدایه انتخاب و ژن پروتئین پوششی به اندازه 714 جفت باز با استفاده از تکثیر شدند. پس از همسانه سازی و تعیین ترادف ژن پروتئین پوششی، RT-PCR آغازگر اختصاصی در روش درخت فیلوژنی رسم شد. نتایج حاصل بیانگر آن است که جدایه های ایرانی و تعدادی از جدایه های گزارش شده در تقسیم گردید. دو جدایه IIB و IIA نیر به دو زیر گروه II تقسیم می شوند. گروه II و I دنیا به دو گروه اصلی ایرانی به صورت مجزا در این دو زیر گروه قرار گرفتند. کمترین و بیشترین شباهت ترادف نوکلئوتیدی جدایه های بین جدایه CP 99 می باشد. مقایسه ترادف نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی ژن / 93 و 2 / ایرانی با یکدیگر به ترتیب 3 بیانگر آن است که این ژن از ترادف حفاظت شده زیادی برخوردار می باشد.

Keywords:

سیب زمینی X پروتئین پوششی , درخت فیلوژنتیکی , ویروس