مریم نصرتی - دانشجوی دکتری رشته ژنتیک و اصلاح نژاددام، دانشگاه فردوسی مشهد
مجتبی طهمورث پور - دانشیار رشته ژنتیک و اصلاح نژاددام، دانشگاه فردوسی مشهد

بیماری برونشیت عفونی طیور یک بیماری مسری در جوجه های جوان است که علیرغم واکسیناسیون علیه آن گزارشاتی از از 13 S ژن S شیوع و ظهور ویروس جدید این بیماری در کشور مشاهده میشود. در این پژوهش توالی پروتئینی زیر واحد 1 سویه رفرنس با 15 جدایه ایرانی بدست آمده از بانک ژن مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت. توالیها ی مورد بررسی با نرم افزار BioEditهمردیفی و ویرایش شد. ترسیم درخت فیلوژنی با نرم افزار MEGA4 و با استفاده از روش اتصال همسایه با1000Bootstrap ترسیم شد. نواحی بسیار متغییر در فاصله 105-56، 140-125 و 307-290 مشخص گردید. ناحیه حفاظت شده در فاصله اسیدهایآمینه 242 تا 256 شناسایی شد. با ترسیم درخت فیلوژنی این 24 سویه/جدایه به چهار خوشه اصلیIR-III ,china ,IR-II ,IR-I تقسیم شد. جدایه های IRFIBV(6,7,13,13b,20&31) در گروه استرالیایی(IR-I)و جدایه IRFIBV44در گروه ماساچوست(IR-II)و جدایه های IR-1062-GA ،IR-1061-PH ،IRFIBV(32, 35, 36, 41 &43) وIR-3654-VMدر گروه اروپایی(IR-III)خوشهبندی شد. تشابه بین جدایههای مختلف ایران بین99-70% بود که حداکثر آن ( 99 %) بین جدایه های IR-1061-PH و IR-1062-GA و حداقل آن ( 70 %) بین سویه IR-3654-VMبا IRFIBV44 بود. تشابه اغلب جدایههای ایرانی با سویههای ماساچوست 73-70% بود.تشابه بین جدایههای ایران با سویه های استرالیایی 79-72% و با سویههای اروپا 90-89% بود. به نظر میرسد عدم کارایی کامل واکسن در پیشگیری از شیوع بیماری میتواند بدلیل همولوژی پایین بین جدایههای ایران و سویههای تجاری واکسن و یا ایجاد ویروس جدید در اثرنوترکیبی و جهش باشد.

ویروس برونشیت عفونی، توالی پروتئین، درخت فیلوژنی، همولوژی