CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی تغییرات در الگوی بیان ژن در طی تنشهای شوری و اکسیداتیوبا استفاده از تجزیه و تحلیل داده های میکرواری در آرابیدوپسیس

عنوان مقاله: بررسی تغییرات در الگوی بیان ژن در طی تنشهای شوری و اکسیداتیوبا استفاده از تجزیه و تحلیل داده های میکرواری در آرابیدوپسیس
شناسه ملی مقاله: NBCI07_0523
منتشر شده در هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران در سال 1390
مشخصات نویسندگان مقاله:

احمد طهماسبی - بخش زراعت واصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
اسماعیل ابراهیمی - بخش زراعت واصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
منصور ابراهیمی - گروه پژوهشی بیوانفورماتیک، پژوهشکده سبز، دانشگاه قم
محسن جعفرزاده - بخش زراعت و اصلاح نباتات دانکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان

خلاصه مقاله:
تنشهای غیر زنده رشد و توسعه گیاهان را تحت تاثیر قرار میدهند. واکنشهای گیاه در برابر آنها با تغییرات زیادی در شبکههای پیچیده ژن همراه است. در پژوهش حاضر تغییرات در الگوی بیان ژنها در شرایط تنش شوری و اکسیداتیو و ارتباط بین آنها در گیاه آرابیدوپسیس مورد بررسی قرار گرفت. دادههای خام شرایط کنترل و تنش از پایگاه دادهTAIR گرفته شد .جهت تعیین تفاوت معنیداری بیان ژنها بین شرایط کنترل و تنش از روش t-test استفاده شد. نتایج نشان داد که به ترتیب بیان 1721 و 1084 ژن پس از تنش شوری و اکسیداتیو در برگ افزایش یافته است. همچنین بیان 83 ژن در هر دو تنش کارکردی ژنهایی که در هر دو تنش افزایش بیان داشتهاند نشان داد که نزدیک به 38 درصد از آنها در گروه های RNA پروتئین، پیام رسانی وDNAدخالت دارند. شوری و اکسیداتیو افزایش یافت که نشان دهنده ارتباط قوی بین پاسخهای تنش شوری و اکسیداتیو میباشد . آنالیز ترکیب

کلمات کلیدی:
تنش، میکرواری، آرابیدوپسیس، بیوانفورماتیک

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/375977/