CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

آنالیز فیلوژنتیک ژن P5CSدر گونههای مختلف بر اساس توالیهای کد کننده با استفاده ازتکنیکin silico AFLP

عنوان مقاله: آنالیز فیلوژنتیک ژن P5CSدر گونههای مختلف بر اساس توالیهای کد کننده با استفاده ازتکنیکin silico AFLP
شناسه ملی مقاله: NBCI07_0591
منتشر شده در هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران در سال 1390
مشخصات نویسندگان مقاله:

سجاد منصوری - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
هادی خارستانی - دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ایلام
محمد حیدرنژادیان - دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرمانشاه
هوشنگ ناصری راد - عضو هیئت علمی دانشگاه پیام نور استان ایلام

خلاصه مقاله:
ژن پرولین 5 کربوکسیلات سینتاز (P5CS)در پاسخ گیاهان به تنش های شوری و خشکی نقش مهمی ایفا می کند . به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی این ژن در هشت گونه گیاهی، آنالیز in silico AFLPبر روی توالی های کد کننده(cDNA) آن انجام شد. پس از هضم آنزیمی توالیها توسط دو آنزیم برشی HpyF44III و EcoVIIIپروفیل قطعات حاصل ترسیم شد پروفیل قطعات تولید شده نشان داد که 10 باند مشترک (هم اندازه) در بین گونه ها وجود دارد. کوچکترین و بزرگترین قطعه به ترتیب دارای 14 جفت باز در گونهEuonymus japonicus و 973 جفت باز در گونه درخت فیلوژنتیکی حاصل از این آنالیز با استفاده از روش حداکثر درست نمایی و الگوریتمNeighbor joining هشت گونه مورد مطالعه را در 4 کلاستر قرار داد.

کلمات کلیدی:
آنالیز فیلوژنتیک، ژن in silico AFLP ،P5CS

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/376045/