طراحی آنتیژن چند اپیتوپی برای شناسایی آنتی بادی های HBV وکتور PGEX4T1

مقدمه: با وجود پیشرفتهای زیادی که در زمینهی تشخیص و درمان HBV صورت گرفته هنوز این بیماری سالانه 400 میلیون مبتلای مزمن دارد مرگ و میر 1میلیون نفر به طور سالانه در دنیا به سبب این بیماری نشان دهنده ی اهمیت این بیماری است. از طرف دیگر استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی در زمینه ی طراحی و بهینه سازی انواع آنتی ژنهای تشخیصی رویکرد جدیدی است که میتوان با استفاده از نرم افزارها و برنامه های متنوع، پیش بینی های لازم برای طراحی یک آنتی ژن را به سادگی انجام داد. طراحی آنتیژن های چند اپیتوپی تشخیصی برای بیماریهایی مثل عفونت HBV با استفاده از این رویکرد جدید میتواند قدم مناسبی در جهت طراحیهای هدفمندتر و کم هزینه تر باشد. هدف:طراحی آنتیژن چنداپیتوپی برای تشخیص HBV و کلون کردن ژن آن در وکتور PGEX4T1 روش: بررسی های متعدد بیوانفورماتیکی از جمله پیش بینی اپیتوپی، پیش بینی ساختارهای دوم و سوم و بهینه سازی ساختارهای سوم برای طراحی آنتی ژن سپس سفارش ژن مورد نظر برای سنتز و در نهایت کلون کردن در وکتور PGEX4T1.نتیجه: با استفاده از بررسی های بیوانفورماتیک آنتی ژن چنداپیتوپی طراحی شد و ویژگی های متعدد آن برای هدف شناسایی آنتی بادیهای علیه آنتی ژنهای اصلی BHV به دقت بررسی و بهینه سازی شد و در نهایت ساختار سوم احتمالی برای آنتی ژن پیش بینی و بهینه سازی گشت تا به راحتی در سیستم باکتری E.coli قابل بیان باشد. ژن مربوطه نیز به گونه ای که مناسب برای بیان در E.coli باشد طراحی و بهینهسازی گشت.در نهایت پس از سفارش ژن با موفقیت در وکتور PGEX4T1 بین دو جایگاه برش BamH1 و Xho1 کلون گشت.

Keywords:

ابزارهای بیوانفورماتیکی , PGEX4T آنتیژن چنداپیتوپی , وکتور 1 , HBV