بررسی ساختار سه بعدی و خصوصیات آنزیم لاکاز از دیدگاه بیوانفورماتیک

اکسیدازهای چند مسی هستند، که اکسیداسیون دامنه وسیعی از ترکیبات فنولیک، آمینهای آروماتیک و (EC لاکازها ( 1.10.3.2 ( Loera. C et al ) . حتی ترکیبات غیرآلی مشخصی را با استفاده از اکسیژن مولکولی به عنوان پذیرنده الکترون کاتالیز میکنندهدف اصلی این تحقیق بررسی ساختار و خصوصیات آنزیم لاکاز به عنوان یک مولکول زیستی از دیدگاه بیوانفورماتیک میباشد. در این تحقیق با استفاده از بانکهای اطلاعاتی و نرم افزارهای مختلفی که در زمینه پروتئین وجود داشت، آنالیز جامعی در مورد آنزیم ,PredictProtein ,Rasmol و نرم افزارهای Uniprot و NCBI ,PDB مورد نظر انجام شد. در این راستا از پایگاههای اطلاعاتی استفاده شد. با استفاده از این نرم افزارها ساختار ثانویه Prot scale وDNAStar ,GeneDoc ,PSIPRED ,Ligand Explorer آنزیم با دقت 80 % تعیین گردید، الگوی آبگریزی و نمودار مربوط به آن ترسیم گردید، محتوی اسیدآمینهای آنزیم مشخص شد، نواحی حفاظت شده پروتئین تعیین گردید و در نهایت محل اتصال لیگاند در ساختار سه بعدی آنزیم مورد آنالیز قرار گرفت. امروزه رشد سریع دادهها و اطلاعات مربوط به پروتئینها، اهمیت بیوانفورماتیک را به عنوان ابزاری مهم در سازماندهی این اطلاعات بیشتر از هر زمان دیگری آشکار ساخته است.

Keywords:

آنزیم لاکاز , آنالیز بیوانفورماتیکی , ساختار سه بعدی پروتئین