انتخاب مناسب ترین ژن های رفرنس جهت مطالعات real-time PCR در مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهیان

Publish Year: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,290

This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI07_1058

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

در مطالعاتی که از تکنیک Real-time PCR کمی استفاده می شود، بمنظور کمی سازی داده های حاصل از اندازه گیری سطوح mRNA می بایست میزان mRNA ژن هدف را نسبت به میزان mRNA یک ژن رفرنس داخلی نرمال سازی کرد. از آنجا که سطح بیان ژن کنترل داخلی می بایست در بین بافت های مختلف و نیز تمامی مراحل رشد یک موجود زنده ثابت بوده و نیز تحت تأثیر تیمارهای آزمایش قرار نگیرد، در هر یک از آزمایش های بیان ژن می بایست ثبات و پایداری بیان چندین ژن رفرنس مورد آزمایش و ارزیابی قرار گیرد تا مناسب ترین ژن رفرنس بمنظور نرمال سازی داده های حاصل از بیان ژن هدف انتخاب گردد. در مطالعه حاضر ثبات بیان شش ژن رفرنس شامل actin- beta (ACTB) و Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) و Ribosomal protein L6 (RPL6) و Ubiquitin (UBQ) و Ribosomal protein L13 (RPL13) و Elongation factor 1-alpha (EF1A) در طی مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی با استفاده از تکنیک TaqMan Real-Time PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. برآیند کلی نتایج حاصل از نرم افزارهای geNorm و Bestkeeper و NormFinder نشان داد که دو ژن RPL6 و ACTB از بیشترین ثبات بیان ژن برخوردار بودند، در حالیکه ژن RPL13 بیشترین تغییرات بیان ژن را از خود نشان داد. بر این اساس استفاده از ژن های ACTB ،RPL6 و نیز میانگین هندسی آنها بمنظور نرمال سازی داده های بیان ژن هدف در مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی و نیز سایر گونه های تاسماهیان توصیه می شود.

Keywords:

تاسماهی ایرانی , مراحل ابتدایی رشد و تکامل , ژن رفرنس

Authors

آرش اکبر زاده

دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشکده منابع طبیعی، گروه شیلات و محیط زیست، کرج، ایران

حمید فرحمند

دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشکده منابع طبیعی، گروه شیلات و محیط زیست، کرج، ایران

فروزنده محجوبی

پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری (NIGEB)، تهران، ایران

کمال الدین حق بین

پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری (NIGEB)، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Andersen, _ L, Jensen, J. L., Orntoft, T.F., 2004. Normalization ...
  • Bustin, S. A., 2000. Absolute quantification of mRNA using real-time ...
  • Dheda, K., Huggett, J. F., Chang, J. S., Kim, L. ...
  • McCurley, A. T., Callard, G. V., 2008. Characteriz ation of ...
  • Mitter, K., Kotoulas, G., Magoulas, A., Mulero, V., Sepulcre, P., ...
  • Pfaffl, M. W., Tichopad, A., Prgomet, C., Neuvians, T. P., ...
  • Saele, O., Nordgreen, A, Hamre, K., Olsvik, P. A., 2009. ...
  • Tang, R. Y., Dodd, A., Lai, D., McNabb, W. C., ...
  • Van desompele, J., De Preter, K., Pattyn, F., Poppe, B., ...
  • Zhong, Q., Zhang, Q., Wang, Z., Qi, J., Chen, Y., ...
  • Department of Fisheries and Environmentl Sciences, Faculty of Natural Resources, ...
  • National Instittute of Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), P.O. Box ...
  • Division of Genetics and Physiology, Department of Biology, University of ...
  • نمایش کامل مراجع