بررسی پروتئوم غشاء پلاسمایی آرابیدوپسیس با روش 2D-LC-MALDI-TOF-MS/MS
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 773
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0041
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
غشاء پلاسمای بعنوان رابطی بین عوامل محیطی و داخل سلول نقش ساختاری و عملکردی در تبادل اطلاعات و مواد دارد. انتقال سیگنالهای درگیر در پاسخ به عوامل تنشزا (زیستی و غیرزیستی) در غشای پلاسمایی رخ میدهد. پروتئومیکس غشاء گیاهی میتواند اطلاعات ارزشمندی در مورد فرآیندهای گیاهی را فراهم آورد. در این تحقیق با استفاده از روش 2DLC و طیف سنجی جرمی به روش MALDI-TOF-MS/MS با برنامه Mascot با استفاده از منابع پایگاه TAIR8 بیش از 1200 پروتئین غشائی برگ گیاه آرابیدوپسیس شناسایی گردید. بیش از 900 پروتئین با ضریب اطمینان 99% و بیش از دو پپتید مشخص گردید. جهت تعیین عملکرد و دومین پروتئینها از پایگاههای PPDB و TAIR استفاده گردید و باتوجه به اطلاعات بدست آمده و براساس نوع عملکرد، پروتئینها در شش گروه : حاملها، پیام رسانها، پروتئینهای تنش، وزیکولها و پروتئینهای دیواره سلولی تقسیمبندی شدند که قسمت اعظم پروتئینها دارای عملکرد ناشناخته بودند و در کل 69 پروتئین شناخته شده جزء گروه گیرنده های شبه کینازی بودند. در مقایسه با سایر روشها، روش بکار رفته در این تحقیق تعداد بیشتری از پروتیین های پیش بینی شده در غشای پلاسمایی را در سطح پروتئین شناسایی کرد.
Keywords:
Authors
پرویز حیدری
دانشجوی دکتری اصلاح نباتات - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حمید نجفی زرینی
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :