CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی پروتئوم غشاء پلاسمایی آرابیدوپسیس با روش 2D-LC-MALDI-TOF-MS/MS

عنوان مقاله: بررسی پروتئوم غشاء پلاسمایی آرابیدوپسیس با روش 2D-LC-MALDI-TOF-MS/MS
شناسه ملی مقاله: NBCI08_0041
منتشر شده در هشتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران و چهارمین همایش ملی امنیت زیستی در سال 1392
مشخصات نویسندگان مقاله:

پرویز حیدری - دانشجوی دکتری اصلاح نباتات - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حمید نجفی زرینی - استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

خلاصه مقاله:
غشاء پلاسمای بعنوان رابطی بین عوامل محیطی و داخل سلول نقش ساختاری و عملکردی در تبادل اطلاعات و مواد دارد. انتقال سیگنالهای درگیر در پاسخ به عوامل تنشزا (زیستی و غیرزیستی) در غشای پلاسمایی رخ میدهد. پروتئومیکس غشاء گیاهی میتواند اطلاعات ارزشمندی در مورد فرآیندهای گیاهی را فراهم آورد. در این تحقیق با استفاده از روش 2DLC و طیف سنجی جرمی به روش MALDI-TOF-MS/MS با برنامه Mascot با استفاده از منابع پایگاه TAIR8 بیش از 1200 پروتئین غشائی برگ گیاه آرابیدوپسیس شناسایی گردید. بیش از 900 پروتئین با ضریب اطمینان 99% و بیش از دو پپتید مشخص گردید. جهت تعیین عملکرد و دومین پروتئینها از پایگاههای PPDB و TAIR استفاده گردید و باتوجه به اطلاعات بدست آمده و براساس نوع عملکرد، پروتئینها در شش گروه : حاملها، پیام رسانها، پروتئینهای تنش، وزیکولها و پروتئینهای دیواره سلولی تقسیمبندی شدند که قسمت اعظم پروتئینها دارای عملکرد ناشناخته بودند و در کل 69 پروتئین شناخته شده جزء گروه گیرنده های شبه کینازی بودند. در مقایسه با سایر روشها، روش بکار رفته در این تحقیق تعداد بیشتری از پروتیین های پیش بینی شده در غشای پلاسمایی را در سطح پروتئین شناسایی کرد.

کلمات کلیدی:
پروتئین ، غشاء پلاسمایی، آرابیدوپسیس، طیف سنجی جرمی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/376640/