وحید مرادی وحدت - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کردستان
مریم مرادی وحدت - دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه بین المللی قزوین
لیلا اکبری - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه شهرکرد
خالد میرزایی - دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه شهرکرد

یکی از مهمترین پروتئین های که در بحث خاموشی ژن و ایجاد small RNA ها نقش فعال و بسزایی دارند، پروتئین های آرگونات می باشند. هدف از این تحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی پروتئین های آرگونات موجود در گیاه شلغم با استفاده از ابزار و روش های بیوانفورماتیکی بود. توالی های پروتئین های آرگونات گیاه شلغم، از پایگاه اطلاعاتی موردنظر دریافت شد، سپس همردیفی توالی های، ساختار سه بعدی، دامنه ها و درخت فیلوژنی این پروتئین ها مشخص شد و در انتها خصوصیات بیشتری از این پروتئین ها مورد بررسی قرار گرفت. این تحقیق نشان داد که شلغم دارای 13 پروتئین آرگونات می باشد. پروتئین های آرگونات موجود در گیاه شلغم مانند سایر گیاهان به طور کلی دارای سه دامنه اصلی به نام های PAZ, MID و PIWI می باشند که پروتئین آرگونات شماره 5 شلغم علاوه بر سه دامنه ی اصلی ذکر شده دو دامنه ی دیگر به نام های CIMS_N_terminal_like و CIMS_C_terminal_like را نیز دارا می باشد، که وجود این دامنه ها در پروتئین های آرگونات یک گیاه برای اولین بار گزارش می شود و تا به حال در سایر گیاهان و حیوانات گزارش نشده است.

بیوانفورماتیک، پروتئین های آرگونات، شلغم