بررسی ترجیح کدونی آیزوفرم های مختلف ژن رمز کننده فسفات ترانسپورتر درگیاهان مختلف

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی ژن های رمز کننده فعالیت ترانسپورتر (PHO) در گیاهان مختلف توالی 60 آیزوفرم از 8 گیاه مختلف (Glycine max, Hordeum vulgare subsp. vulgare, Oryza sativa Japonica, Populustrichocarpa, Ricinus communis, Sorghum, Triricum aestivum, Vitis vinifera) از پایگاه NCBI تهیه شد و توسط برنامه gene infinity مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج نشان داد که برای اسید آمینه های دارای دو و سه کدون ترجیح، کدونی ترجیح داده شده بود که نوکلئوتید انتهایی آن Tیا C بود. برای اسیدآمینه های چهار کدونی آلانین (Ala)، گلایسین (Gly)، پرولین (Pro) و تیروزین (Thr) بیشترین ترجیح برای کدونی بود که دارای نوکلئوتید انتهایی A یا T بود. برای اسید آمینه های دارای شش کدون، ترجیح کدونی کاملا متفاوت بود اما به طور کلی میزان کدون هایی که انتهای آنها Aیا G بود با هم و آنهایی که به T یا C ختم می شدند، با هم مساوی بود. نتایج تجزیه کلاستر براساس میانگین داده های این 8 گیاه نشان داد که گیاهان سویا و سپیدار از نظر ترجیح کدونی با 76% تشابه در یک خوشه قرار گرفته اند که از این نظر بیشترین تشابه را به خود اختصاص داده اند و انگور با 33% کمترین تشابه را با سایر ارقام داشت. به این ترتیب می توان پیشنهاد کرد که احتمالا ترجیح کدونی یکسان در ژن های رمز کننده فسفات ترانسپورتر در گیاهان مختلف وجود دارد.

Keywords:

ترجیح کدونی , فسفات ترانسپورتر , PHO