بررسی بیوانفورماتیکی ژن بتاآمیرین سنتازدرخانواده آستراسه و چندین خانواده گیاهی

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 533

This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0438

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

Abstract:

تریترپنوییدها بزرگ ترین گروه از محصولات طبیعی گیاهی هستندکه دارای تنوع زیادی می باشند. این متابولیت ها درصنعت داروسازی دارای اهمیت زیادی هستند. انواع اولئان ( بتاآمیرین)، اورسان(آلفا آمیرین) و داماران( دامارندیول) دارای بیشترین فراوانی در بین تریترپن ها می باشند. بتاآمیرین با اسکلت اولئانی توسط آنزیم بتاآمیرین سنتاز با پیش ماده اکسید و اسکوالن ایجاد می شود. ژن کدکننده این آنزیم در گونه های مختلف گیاهی از جمله در خانواده Asteraceae در دوجنس Aster و Artemisia توالی یابی شده است. هدف از مطالعه بررسی بیوانفورماتیکی ژن مزبور می باشد. توالی های آمینو اسیدی بتاآمیرین مربوط به چندین خانواده گیاهی ازپایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد، سپس همردیفی توالی ها با استفاده از نرم افزار clustalW صورت گرفت و درخت فیلوژنی این پروتئین رسم گردید. نتایج نشان می دهد که پروتئین بتاآمیرین در خانواده Asteraceae رابطه فیلوژنی نزدیکتری با جنس Solanum از خانواده Solanaceae و جنس Gentiana از خانواده Gentiaceae دارد. سایز این پروتئین دربین گیاهان تحت بررسی در محدوده 779-755 اسیدآمینه است. بیشترین وزن آن متعلق به گونه Betula platyphylla می باشد. نقطه ایزوالکتریک این پروتئین در محدوده 7-6 است و بیشترین شاخص الیفاتیک که به عنوان یک عامل مثبت برای افزایش مقاومت حرارتی می باشد مربوط به گونه Gentiana stramineaاست.

Authors

ژیلا حسین پناهی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان

اسعد معروفی

عضو هیئت علمی گروه بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Aggarwal, B. B., Sundaram, C., Malani, N., Ichikawa, H., 2007. ...
  • Augustin, J. M., Kuzina, V., Andersen, S. B., Bak, S., ...
  • Bramley, P. M., 1997. Isoprenoid metabolismm. Journal of Plant Biochemistry, ...
  • Cammareri, M., Consiglio, M. F., Pecchia, P., Corea, G., Lanzotti, ...
  • Irmler, S., Schroder, G., St-Pierre, B., Crouch, N. P., Hotze, ...
  • Shibuya, M., Katsube, Y., Otsuka, M., Zhang, H., Tansakul, P., ...
  • Tamura, K., Dudley, J., Nei, M., Kumar, S., 2007. MEGA4: ...
  • improving the sensitivity ب [8] Thompson, J. D., Higgins, D. ...
  • Xu, R., Fazio, G. C., Matsuda, S. P. T., 2004. ...
  • 557 87.993 87.247 87.564 87.589 87.208 87.218 87.515 87.072 87.373 ...
  • نمایش کامل مراجع