شناسایی ژن های دفنسین در گیاه توت فرنگی(Fragaria vesca) با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی
Publish place: 8th national biotechnology congress of I.R. Iran & 4th National Conference on biosecurity
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 723
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0462
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
موجودات زنده، شامل گیاهان معمولا در معرض پاتوژن های بی شماری در طبیعت قرار دارند. آن ها در پاسخ به حمله پاتوژن ها یک سیستم ایمنی ذاتی تکاملی توسعه داده اند. دفنسین های گیاهی پپنیدهای کوچک، بسیار پایدار و غنی از سیستئین هستند که بخشی از سیستم ایمنی ذاتی، که عمدتا در برابر پاتوژن های قارچی معطوف شده اند را تشکیل داده است. گیاهان تراریختی که بیش بیان دفنسین دارند در برابر پاتوژن های قارچی شدیدا مقاوم هستند. دفنسین های گیاهی به روشنی نشان دادند اگر چه توالی حفاظت شده محدود دارند اما هشت ریشه سیستئینی و یک گلایسین در جایگاه 34 کاملا حفظ شده دارند. همچنین در بیشتر موارد، گلایسین دوم (جایگاه 13) ، سرین(جایگاه 8) یک ریشه آروماتیک (جایگاه 11) و یک اسید گلوتامیک (جایگاه 29) حفظ شده دارند که از این مناطق می توان برای شناسایی ژن های دفنسین در گیاهان هم خانواده استفاده کرد. در این مطالعه توالی های EST ژن دفنسین گیاهان هم خانواده مانند سیب و هلو برای شناسایی ژن دفنسین در توت فرنگی مورد استفاده قرار گرفت. در نهایت سه گروه مجزا از ژن های دفنسین در توت فرنگی شناسایی شد که می توان از مناطق حفظ شده این گروه ها پرایمر طراحی نمود و ژن مورد نظر را برای بررسی بیشتر کلون کرد.
Keywords:
Authors
بهزاد ظهیر نژاد
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان
بهمن بهرام نژاد
استادیار گروه بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه کردستان
مونا نصری
دانشجوی کارشناسی ارشد جنگل داری دانشکده منابع طبیعی دانشگاه کردستان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :